37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1131 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1131  AAA ATPase  100 
 
 
600 aa  1184    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0162  hypothetical protein  44.41 
 
 
591 aa  470  1.0000000000000001e-131  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.222598  normal  0.0745617 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06795  hypothetical protein  23.85 
 
 
516 aa  56.2  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.207511  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4099  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  23.69 
 
 
530 aa  54.7  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0823505  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2544  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  22.56 
 
 
526 aa  54.7  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25990  predicted ATPase  24.93 
 
 
540 aa  53.1  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22220  predicted ATPase  22.64 
 
 
544 aa  52.8  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.198348 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1849  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  24 
 
 
511 aa  52.8  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.892343  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2180  AAA ATPase  22.16 
 
 
777 aa  52  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.520189  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2315  hypothetical protein  22.16 
 
 
1743 aa  51.2  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1133  hypothetical protein  24.24 
 
 
496 aa  51.6  0.00005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0435  conjugal transfer ATPase TrbE  20.56 
 
 
817 aa  50.8  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1898  conjugal transfer ATPase TrbE  21.27 
 
 
817 aa  50.4  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2648  conjugal transfer ATPase TrbE  20.7 
 
 
825 aa  50.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.947837  normal  0.965174 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0738  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  24.33 
 
 
557 aa  50.1  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1283  hypothetical protein  24.04 
 
 
517 aa  50.4  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.608046  normal  0.929249 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1344  conjugal transfer ATPase TrbE  21.45 
 
 
819 aa  50.4  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2353  conjugal transfer ATPase TrbE  21.33 
 
 
816 aa  49.3  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.344124 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1553  conjugal transfer ATPase TrbE  22.26 
 
 
809 aa  48.9  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.215631  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2908  conjugal transfer ATPase TrbE  20.33 
 
 
811 aa  48.1  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.380632  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1285  conjugal transfer ATPase TrbE  21.69 
 
 
816 aa  47.8  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3703  conjugal transfer ATPase TrbE  21.85 
 
 
817 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.165131  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4413  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  22.4 
 
 
523 aa  47.8  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2007  conjugal transfer ATPase TrbE  21.53 
 
 
816 aa  47.4  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.581672  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0246  hypothetical protein  22.76 
 
 
1577 aa  47  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0577  hypothetical protein  23.59 
 
 
493 aa  46.2  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0760  hypothetical protein  26.09 
 
 
492 aa  45.8  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.360251  normal  0.0367515 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1319  conjugal transfer ATPase TrbE  20.56 
 
 
819 aa  46.2  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2953  hypothetical protein  21.84 
 
 
456 aa  45.4  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0311686  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1273  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  22.95 
 
 
520 aa  45.4  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.50823  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30910  conjugal transfer ATPase TrbE  21.21 
 
 
817 aa  45.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000414209  unclonable  1.71741e-21 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3713  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  23.04 
 
 
580 aa  45.1  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2581  conjugal transfer ATPase TrbE  20.09 
 
 
816 aa  45.1  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0884  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  23.89 
 
 
843 aa  44.7  0.005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0635  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  22.59 
 
 
513 aa  44.3  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4178  hypothetical protein  20.9 
 
 
874 aa  44.3  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0161122 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5240  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like  30.21 
 
 
779 aa  43.5  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>