25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2315 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_0466  hypothetical protein  48.24 
 
 		 1692 aa  1642    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.189828  normal  0.0732856 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2315  hypothetical protein  100 
 
 		 1743 aa  3608    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0826  hypothetical protein  26.07 
 
 		 1734 aa  303  3e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2518  hypothetical protein  33.99 
 
 		 1830 aa  175  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.577468  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1491  hypothetical protein  31.58 
 
 		 1810 aa  165  8.000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2180  AAA ATPase  26.28 
 
 		 777 aa  82.8  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.520189  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1373  AAA ATPase  22.89 
 
 		 572 aa  80.5  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.280618  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0246  hypothetical protein  22.48 
 
 		 1577 aa  67  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0053  hypothetical protein  30.87 
 
 		 547 aa  64.7  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.594463 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1088  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  27.16 
 
 		 1633 aa  63.9  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8579  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.52 
 
 		 595 aa  56.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161073  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  26.73 
 
 		 605 aa  55.5  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  25.63 
 
 		 496 aa  54.7  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5417  hypothetical protein  24.32 
 
 		 1698 aa  51.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.265481  normal  0.989313 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1871  hypothetical protein  22.25 
 
 		 550 aa  51.2  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1131  AAA ATPase  22.16 
 
 		 600 aa  51.2  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2744  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.9 
 
 		 630 aa  50.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00908166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0709  protein of unknown function DUF87  21.43 
 
 		 714 aa  50.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2548  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.52 
 
 		 629 aa  49.7  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0379852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4476  protein of unknown function DUF87  27.59 
 
 		 593 aa  49.7  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  24.42 
 
 		 611 aa  48.9  0.0009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1693  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  24.31 
 
 		 629 aa  48.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000521447  normal  0.17897 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0025  hypothetical protein  30.14 
 
 		 500 aa  47.4  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  23.68 
 
 		 608 aa  47  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1070  hypothetical protein  21.82 
 
 		 452 aa  45.8  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>