48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1088 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1088  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  100 
 
 
1633 aa  3279    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0466  hypothetical protein  26.76 
 
 
1692 aa  87.4  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.189828  normal  0.0732856 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2315  hypothetical protein  27.16 
 
 
1743 aa  74.3  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2518  hypothetical protein  24.85 
 
 
1830 aa  71.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.577468  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2953  hypothetical protein  23.9 
 
 
456 aa  67.8  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0311686  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1491  hypothetical protein  22.96 
 
 
1810 aa  63.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5417  hypothetical protein  26.44 
 
 
1698 aa  63.9  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.265481  normal  0.989313 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0246  hypothetical protein  25.73 
 
 
1577 aa  59.7  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2180  AAA ATPase  23.17 
 
 
777 aa  58.5  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.520189  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4588  cell divisionFtsK/SpoIIIE  24.37 
 
 
1812 aa  57  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0096  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  25.5 
 
 
490 aa  55.8  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0107  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  25.5 
 
 
490 aa  55.5  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3313  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  25.81 
 
 
565 aa  52.4  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1553  conserved hypothetical protein  30.97 
 
 
998 aa  52.4  0.00008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0089  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  24.93 
 
 
491 aa  52  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1183  AAA ATPase  25.8 
 
 
1043 aa  51.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2524  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  30.82 
 
 
478 aa  50.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.6508 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0911  ATPase-like protein  25.27 
 
 
989 aa  51.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2022  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  31.82 
 
 
557 aa  50.1  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.27586  normal  0.0150658 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0578  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  32.26 
 
 
520 aa  49.3  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215105  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0467  ATPase-like protein  23.82 
 
 
1034 aa  48.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0175  DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE-related protein  24.57 
 
 
1807 aa  47.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.78855  hitchhiker  0.000743422 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0091  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  25.78 
 
 
488 aa  47.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0259973  normal  0.193086 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1184  DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE-related protein  24.57 
 
 
1807 aa  47.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.274643  normal  0.284546 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1296  hypothetical protein  30 
 
 
599 aa  48.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1312  protein of unknown function DUF87  24 
 
 
911 aa  47.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00374873  unclonable  0.0000000332559 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2804  hypothetical protein  25.87 
 
 
693 aa  47.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0645  ATPase-like protein  23.24 
 
 
989 aa  47.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5744  hypothetical protein  25.21 
 
 
590 aa  48.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575418 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3852  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  24.45 
 
 
505 aa  46.6  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1018  ATPase  30.59 
 
 
463 aa  47  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0915  hypothetical protein  26.16 
 
 
463 aa  47  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4789  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  28.93 
 
 
514 aa  47  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.851867 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1636  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  25.64 
 
 
526 aa  47  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.985803  normal  0.278037 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3949  hypothetical protein  32.58 
 
 
513 aa  46.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0243  putative NPT hydrolase  32.58 
 
 
513 aa  46.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0650533  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3706  hypothetical protein  32.58 
 
 
513 aa  46.6  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3542  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  31.62 
 
 
543 aa  46.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416289  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4924  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  26.26 
 
 
515 aa  46.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.311979 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0564  hypothetical protein  31.3 
 
 
503 aa  46.2  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0920  putative ATP-binding protein  23.15 
 
 
1090 aa  46.2  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.061859  normal  0.0138151 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0632  cell divisionFtsK/SpoIIIE  24.12 
 
 
1679 aa  46.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0321  hypothetical protein  22.75 
 
 
499 aa  46.2  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0858  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  30.87 
 
 
514 aa  45.8  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4878  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  26.26 
 
 
521 aa  45.8  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.493177 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0343  hypothetical protein  25.48 
 
 
499 aa  45.8  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0563  hypothetical protein  30.53 
 
 
503 aa  45.8  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0934  ATPase-like  24.57 
 
 
1097 aa  45.1  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.39548  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>