68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0920 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0920  putative ATP-binding protein  100 
 
 
1090 aa  2248    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.061859  normal  0.0138151 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1716  ATPase-like protein  25.99 
 
 
1065 aa  269  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00601254 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1825  ATPase-like protein  25.96 
 
 
1065 aa  260  1e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.071271 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0832  hypothetical protein  30.38 
 
 
1037 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0842823  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0817  ATPase  30.43 
 
 
1039 aa  257  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.331244  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1138  hypothetical protein  29.17 
 
 
902 aa  241  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1250  ATPase  29.6 
 
 
1040 aa  207  7e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.515643 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0645  ATPase-like protein  30.37 
 
 
989 aa  206  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0467  ATPase-like protein  32.53 
 
 
1034 aa  202  3e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0911  ATPase-like protein  32.05 
 
 
989 aa  199  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5437  ATPase-like protein  28.18 
 
 
1143 aa  192  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.384057  normal  0.0313008 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0934  ATPase-like  30.65 
 
 
1097 aa  189  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.39548  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1312  protein of unknown function DUF87  31.5 
 
 
911 aa  183  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00374873  unclonable  0.0000000332559 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1089  hypothetical protein  30.08 
 
 
930 aa  165  4.0000000000000004e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0247852  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1259  protein of unknown function DUF87  24.43 
 
 
540 aa  73.9  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2263  ATPase-like protein  25.21 
 
 
533 aa  73.9  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.539345 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1887  hypothetical protein  20.8 
 
 
870 aa  72.8  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  28.57 
 
 
508 aa  65.9  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  29.66 
 
 
496 aa  64.3  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0326  hypothetical protein  25.52 
 
 
497 aa  64.3  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.519227  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1408  hypothetical protein  25.46 
 
 
497 aa  62.4  0.00000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.502855  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0511  hypothetical protein  25.2 
 
 
497 aa  62.4  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0577  hypothetical protein  26.2 
 
 
493 aa  62.4  0.00000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1515  protein of unknown function DUF87  22.22 
 
 
530 aa  61.6  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.649754  normal  0.132485 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1374  protein of unknown function DUF87  24.5 
 
 
538 aa  61.2  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.627609 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1133  hypothetical protein  25.13 
 
 
496 aa  59.7  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4054  protein of unknown function DUF87  26.74 
 
 
709 aa  59.3  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0459328  n/a   
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5297  protein of unknown function DUF87  36.19 
 
 
563 aa  58.9  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  27.5 
 
 
557 aa  58.5  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1870  protein of unknown function DUF87  24.8 
 
 
559 aa  58.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.853161  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0760  hypothetical protein  22.48 
 
 
492 aa  58.2  0.0000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.360251  normal  0.0367515 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0135  protein of unknown function DUF87  23.8 
 
 
520 aa  55.5  0.000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0231678  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0070  protein of unknown function DUF87  25.2 
 
 
500 aa  55.1  0.000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0712  hypothetical protein  58.97 
 
 
217 aa  55.1  0.000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.7462  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0053  hypothetical protein  25.29 
 
 
547 aa  53.9  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.594463 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1674  protein of unknown function DUF87  31.06 
 
 
591 aa  53.5  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.1078  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0937  hypothetical protein  23.63 
 
 
540 aa  52.4  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0147133  normal  0.254287 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  28.1 
 
 
531 aa  52.8  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1877  protein of unknown function DUF87  23.82 
 
 
560 aa  52.4  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0397  hypothetical protein  23.81 
 
 
325 aa  52  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0983  hypothetical protein  24.18 
 
 
616 aa  50.8  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.495624  hitchhiker  0.0000164054 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1138  hypothetical protein  36.14 
 
 
561 aa  51.2  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2804  hypothetical protein  24.07 
 
 
693 aa  50.1  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0981  hypothetical protein  23.14 
 
 
564 aa  50.4  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0983657  normal  0.0399667 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5753  hypothetical protein  21.49 
 
 
612 aa  50.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.985257  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  23.64 
 
 
608 aa  50.4  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  23.03 
 
 
605 aa  50.1  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1871  hypothetical protein  25 
 
 
550 aa  50.1  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1359  hypothetical protein  24.27 
 
 
570 aa  50.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.997931 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1625  hypothetical protein  22.33 
 
 
783 aa  49.7  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4576  ATPase-like protein  28.14 
 
 
664 aa  49.7  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26835  normal  0.0312719 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  23.03 
 
 
611 aa  49.3  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3715  hypothetical protein  26.71 
 
 
601 aa  49.3  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3279  hypothetical protein  23.56 
 
 
590 aa  48.9  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2356  hypothetical protein  28.92 
 
 
603 aa  48.5  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5744  hypothetical protein  24.67 
 
 
590 aa  47.8  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575418 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3526  hypothetical protein  23.56 
 
 
583 aa  47.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.543626  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5417  hypothetical protein  21.88 
 
 
1698 aa  47  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.265481  normal  0.989313 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1296  hypothetical protein  27.97 
 
 
599 aa  46.6  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1416  protein of unknown function DUF87  22.55 
 
 
617 aa  46.2  0.004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0132  protein of unknown function DUF87  25.71 
 
 
534 aa  45.8  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0970919  decreased coverage  0.000025846 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0451  protein of unknown function DUF87  23.43 
 
 
526 aa  45.4  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2954  hypothetical protein  25 
 
 
589 aa  45.4  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000103337 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0074  hypothetical protein  28.65 
 
 
495 aa  45.1  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0871233  normal  0.176107 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1553  conserved hypothetical protein  21.88 
 
 
998 aa  45.1  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0098  hypothetical protein  29.8 
 
 
623 aa  45.1  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0926  protein of unknown function DUF87  26.52 
 
 
553 aa  44.7  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2116  hypothetical protein  24.86 
 
 
583 aa  44.7  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.137689 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>