51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0934 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5437  ATPase-like protein  63.97 
 
 		 1143 aa  881    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.384057  normal  0.0313008 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0934  ATPase-like  100 
 
 		 1097 aa  2135    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.39548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0911  ATPase-like protein  46.04 
 
 		 989 aa  543  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0645  ATPase-like protein  44.92 
 
 		 989 aa  535  1e-150  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0467  ATPase-like protein  44.82 
 
 		 1034 aa  532  1e-149  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1138  hypothetical protein  34.56 
 
 		 902 aa  274  6e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1250  ATPase  33.99 
 
 		 1040 aa  249  2e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.515643 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0817  ATPase  30.22 
 
 		 1039 aa  228  6e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.331244  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0832  hypothetical protein  30.44 
 
 		 1037 aa  226  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0842823  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1825  ATPase-like protein  33.11 
 
 		 1065 aa  204  6e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.071271 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1716  ATPase-like protein  33.48 
 
 		 1065 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00601254 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1312  protein of unknown function DUF87  32.05 
 
 		 911 aa  201  7e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00374873  unclonable  0.0000000332559 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0920  putative ATP-binding protein  30.05 
 
 		 1090 aa  191  5e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.061859  normal  0.0138151 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1089  hypothetical protein  31.08 
 
 		 930 aa  169  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0247852  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0635  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  24.29 
 
 		 513 aa  69.3  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0494  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  22.7 
 
 		 505 aa  61.6  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1283  hypothetical protein  22.47 
 
 		 517 aa  61.2  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.608046  normal  0.929249 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1273  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  23.06 
 
 		 520 aa  58.2  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.50823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4413  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  24.35 
 
 		 523 aa  57.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0321  hypothetical protein  24.36 
 
 		 499 aa  57  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06795  hypothetical protein  24.21 
 
 		 516 aa  56.6  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.207511  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0343  hypothetical protein  23.89 
 
 		 499 aa  55.5  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3313  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  25.45 
 
 		 565 aa  55.1  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5417  hypothetical protein  26.06 
 
 		 1698 aa  53.5  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.265481  normal  0.989313 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  25.66 
 
 		 508 aa  53.5  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1259  protein of unknown function DUF87  27.34 
 
 		 540 aa  53.1  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3713  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  26.2 
 
 		 580 aa  52  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1849  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  21.39 
 
 		 511 aa  51.6  0.00008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.892343  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1887  hypothetical protein  18.12 
 
 		 870 aa  50.1  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2263  ATPase-like protein  28.1 
 
 		 533 aa  49.7  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.539345 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0482  protein of unknown function DUF87  23.85 
 
 		 577 aa  50.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1416  protein of unknown function DUF87  24.74 
 
 		 617 aa  49.3  0.0004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4054  protein of unknown function DUF87  30.2 
 
 		 709 aa  48.5  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0459328  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4980  hypothetical protein  23.06 
 
 		 570 aa  48.5  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3486  ATPase-like protein  35.53 
 
 		 574 aa  47  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.123894  normal  0.207133 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1373  AAA ATPase  20.67 
 
 		 572 aa  46.2  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.280618  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1701  hypothetical protein  36 
 
 		 539 aa  46.6  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.016697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  25.23 
 
 		 557 aa  46.6  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2544  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  38.96 
 
 		 526 aa  46.6  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4099  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  37.33 
 
 		 530 aa  46.2  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0823505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3644  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  38.89 
 
 		 523 aa  46.2  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.852861  normal  0.874146 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3712  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  38.89 
 
 		 522 aa  45.8  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.534024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0612  hypothetical protein  23.1 
 
 		 906 aa  45.4  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3639  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  38.89 
 
 		 522 aa  45.8  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0432207  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1736  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  42.86 
 
 		 629 aa  45.4  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  29.37 
 
 		 679 aa  45.4  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1340  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  35.8 
 
 		 515 aa  45.1  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0096  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  36.8 
 
 		 490 aa  45.1  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  25.66 
 
 		 496 aa  45.1  0.008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2369  hypothetical protein  30.99 
 
 		 659 aa  44.7  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.70292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  27.93 
 
 		 531 aa  44.7  0.01  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>