30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1373 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1373  AAA ATPase  100 
 
 		 572 aa  1121    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.280618  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0053  hypothetical protein  39.92 
 
 		 547 aa  350  5e-95  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.594463 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0246  hypothetical protein  25.33 
 
 		 1577 aa  87  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2315  hypothetical protein  22.89 
 
 		 1743 aa  80.5  0.00000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0466  hypothetical protein  23.18 
 
 		 1692 aa  77.4  0.0000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.189828  normal  0.0732856 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1693  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  22.05 
 
 		 629 aa  53.5  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000521447  normal  0.17897 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  23.7 
 
 		 508 aa  52.8  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0070  protein of unknown function DUF87  25.07 
 
 		 500 aa  51.2  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1626  hypothetical protein  22.85 
 
 		 300 aa  50.4  0.00008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00633506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0760  hypothetical protein  25.56 
 
 		 492 aa  49.3  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.360251  normal  0.0367515 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2548  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  21.55 
 
 		 629 aa  48.5  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0379852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0731  AAA ATPase  22.04 
 
 		 569 aa  48.1  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0912969  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8579  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.77 
 
 		 595 aa  47.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161073  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0511  hypothetical protein  24.45 
 
 		 497 aa  47.4  0.0008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3925  protein of unknown function DUF87  33.91 
 
 		 581 aa  47  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1238  protein of unknown function DUF87  24.5 
 
 		 575 aa  47  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0934  ATPase-like  20.67 
 
 		 1097 aa  47  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.39548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2744  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  21.69 
 
 		 630 aa  47  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00908166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5437  ATPase-like protein  21.26 
 
 		 1143 aa  46.6  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.384057  normal  0.0313008 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  26.52 
 
 		 611 aa  46.2  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1716  ATPase-like protein  24.27 
 
 		 1065 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00601254 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0981  hypothetical protein  24.51 
 
 		 564 aa  44.7  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0983657  normal  0.0399667 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1978  AAA ATPase  22.89 
 
 		 293 aa  44.7  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0577  hypothetical protein  23.42 
 
 		 493 aa  44.3  0.006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0326  hypothetical protein  24.92 
 
 		 497 aa  44.3  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.519227  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0397  hypothetical protein  21.88 
 
 		 325 aa  43.9  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0911  ATPase-like protein  20.52 
 
 		 989 aa  44.3  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  25 
 
 		 608 aa  43.5  0.009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6849  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  21.77 
 
 		 608 aa  43.5  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0610151  normal  0.925039 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0025  hypothetical protein  25.95 
 
 		 500 aa  43.5  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>