36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_B0025 on replicon NC_009705
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009705  YpsIP31758_B0025  hypothetical protein  100 
 
 		 500 aa  1038    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0246  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1577 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  30.56 
 
 		 523 aa  56.6  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2180  AAA ATPase  25.55 
 
 		 777 aa  54.7  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.520189  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0070  protein of unknown function DUF87  23.05 
 
 		 500 aa  53.5  0.000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1833  hypothetical protein  50 
 
 		 98 aa  51.2  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730999  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1674  protein of unknown function DUF87  29.41 
 
 		 591 aa  50.8  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.1078  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1296  hypothetical protein  38.36 
 
 		 599 aa  50.8  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1011  hypothetical protein  45.45 
 
 		 104 aa  50.1  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.868266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4668  hypothetical protein  37.93 
 
 		 1077 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5417  hypothetical protein  35.8 
 
 		 1698 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.265481  normal  0.989313 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4248  hypothetical protein  29.67 
 
 		 1580 aa  48.1  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00909879  normal  0.515927 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2315  hypothetical protein  30.14 
 
 		 1743 aa  47.4  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6616  hypothetical protein  38.1 
 
 		 1448 aa  47  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0777828  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2465  protein of unknown function DUF87  27.1 
 
 		 600 aa  47  0.0009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6521  TOPRIM  38.1 
 
 		 1448 aa  47  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0017  cpp22  33.33 
 
 		 408 aa  46.2  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.113965  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0451  protein of unknown function DUF87  35.06 
 
 		 526 aa  46.6  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1447  hypothetical protein  35.94 
 
 		 103 aa  45.8  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.83167  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0611  Cpp22  50 
 
 		 430 aa  45.4  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5545  hypothetical protein  33.33 
 
 		 99 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101926 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1480  hypothetical protein  43.48 
 
 		 224 aa  45.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1389  hypothetical protein  27.82 
 
 		 606 aa  45.1  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.103576 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0760  hypothetical protein  21.8 
 
 		 492 aa  44.7  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.360251  normal  0.0367515 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0482  protein of unknown function DUF87  25.2 
 
 		 577 aa  44.7  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0466  hypothetical protein  25.31 
 
 		 1692 aa  44.7  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.189828  normal  0.0732856 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1732  hypothetical protein  24.3 
 
 		 524 aa  44.3  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000995714 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1361  hypothetical protein  26.04 
 
 		 523 aa  44.3  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26972  normal  0.0191854 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0098  hypothetical protein  30.68 
 
 		 623 aa  44.3  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  24.08 
 
 		 508 aa  44.3  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4980  hypothetical protein  32.74 
 
 		 570 aa  43.9  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  36.07 
 
 		 679 aa  43.5  0.009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1373  AAA ATPase  25.95 
 
 		 572 aa  43.5  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.280618  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  23.15 
 
 		 524 aa  43.5  0.01  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  37.21 
 
 		 531 aa  43.5  0.01  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4332  hypothetical protein  37.5 
 
 		 427 aa  43.5  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>