48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0397 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0397  hypothetical protein  100 
 
 
325 aa  649    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1626  hypothetical protein  30.94 
 
 
300 aa  85.9  9e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00633506  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1978  AAA ATPase  31.35 
 
 
293 aa  85.1  0.000000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1259  protein of unknown function DUF87  26.16 
 
 
540 aa  83.6  0.000000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2263  ATPase-like protein  27.18 
 
 
533 aa  78.2  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.539345 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0455  AAA ATPase  30.54 
 
 
295 aa  71.6  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0676149  hitchhiker  0.0000338787 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  25.45 
 
 
508 aa  71.6  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0145  AAA ATPase  29.29 
 
 
295 aa  71.2  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1312  protein of unknown function DUF87  25.19 
 
 
911 aa  62.4  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00374873  unclonable  0.0000000332559 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0645  hypothetical protein  26.24 
 
 
686 aa  62.4  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.549524  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0920  putative ATP-binding protein  23.81 
 
 
1090 aa  60.8  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.061859  normal  0.0138151 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1825  ATPase-like protein  25.36 
 
 
1065 aa  60.8  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.071271 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1716  ATPase-like protein  25.36 
 
 
1065 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00601254 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1138  hypothetical protein  25.65 
 
 
902 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0645  ATPase-like protein  26.72 
 
 
989 aa  55.8  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1133  hypothetical protein  22.63 
 
 
496 aa  52  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2180  AAA ATPase  23.4 
 
 
777 aa  52.4  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.520189  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0053  hypothetical protein  24.77 
 
 
547 aa  51.2  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.594463 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2231  hypothetical protein  38.27 
 
 
521 aa  50.4  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0965874  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0070  protein of unknown function DUF87  27.47 
 
 
500 aa  50.1  0.00006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5417  hypothetical protein  24.68 
 
 
1698 aa  50.1  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.265481  normal  0.989313 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1373  AAA ATPase  24.05 
 
 
572 aa  49.3  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.280618  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1374  protein of unknown function DUF87  24.52 
 
 
538 aa  48.9  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.627609 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0246  hypothetical protein  53.66 
 
 
1577 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  23.81 
 
 
557 aa  48.9  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0738  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  29.03 
 
 
557 aa  48.1  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0467  ATPase-like protein  25.68 
 
 
1034 aa  48.1  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1250  ATPase  24.66 
 
 
1040 aa  48.5  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.515643 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3529  hypothetical protein  30.1 
 
 
536 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.370836 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1768  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  27.52 
 
 
522 aa  46.6  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.307535 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0760  hypothetical protein  24.33 
 
 
492 aa  46.6  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.360251  normal  0.0367515 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2631  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  33.33 
 
 
522 aa  46.2  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1416  protein of unknown function DUF87  26.15 
 
 
617 aa  46.2  0.0008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3313  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  34.72 
 
 
565 aa  45.4  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3712  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  40.98 
 
 
522 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.534024  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3029  hypothetical protein  33.78 
 
 
536 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.998506  normal  0.572623 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0911  ATPase-like protein  26.05 
 
 
989 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3639  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  40.98 
 
 
522 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0432207  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3644  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  40.98 
 
 
523 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.852861  normal  0.874146 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2047  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  27.52 
 
 
536 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.171196  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1936  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  28.44 
 
 
536 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.495042 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  23.19 
 
 
531 aa  43.9  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  22.12 
 
 
496 aa  43.9  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1849  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  38 
 
 
511 aa  43.9  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.892343  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0936  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  35.62 
 
 
521 aa  43.5  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222531  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0494  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  33.77 
 
 
505 aa  43.5  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0321  hypothetical protein  38.1 
 
 
499 aa  43.1  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0579  type II secretion system protein E  40.74 
 
 
576 aa  42.7  0.009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000642239 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>