10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1978 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1978  AAA ATPase  100 
 
 		 293 aa  583  1e-166  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1626  hypothetical protein  65.53 
 
 		 300 aa  393  1e-108  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00633506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0145  AAA ATPase  60.34 
 
 		 295 aa  363  3e-99  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0455  AAA ATPase  63.31 
 
 		 295 aa  345  5e-94  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0676149  hitchhiker  0.0000338787 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0397  hypothetical protein  32.05 
 
 		 325 aa  77.4  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2263  ATPase-like protein  29.46 
 
 		 533 aa  63.2  0.000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.539345 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1259  protein of unknown function DUF87  27.31 
 
 		 540 aa  54.7  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1373  AAA ATPase  22.89 
 
 		 572 aa  45.1  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.280618  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1344  hypothetical protein  27.37 
 
 		 451 aa  43.1  0.006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1553  conserved hypothetical protein  37.97 
 
 		 998 aa  42.7  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>