230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2263 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_2263  ATPase-like protein  100 
 
 
533 aa  1065    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.539345 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1259  protein of unknown function DUF87  40.66 
 
 
540 aa  397  1e-109  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  25.71 
 
 
508 aa  99.8  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0760  hypothetical protein  27.66 
 
 
492 aa  93.2  9e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.360251  normal  0.0367515 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0070  protein of unknown function DUF87  27.1 
 
 
500 aa  91.7  3e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  25.44 
 
 
605 aa  86.3  0.000000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0920  putative ATP-binding protein  25.48 
 
 
1090 aa  85.9  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.061859  normal  0.0138151 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  25.8 
 
 
496 aa  82.8  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  25.5 
 
 
557 aa  80.9  0.00000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  20.9 
 
 
611 aa  80.5  0.00000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0326  hypothetical protein  26.07 
 
 
497 aa  78.6  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.519227  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0397  hypothetical protein  27.18 
 
 
325 aa  78.2  0.0000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1408  hypothetical protein  25.8 
 
 
497 aa  76.3  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.502855  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0135  protein of unknown function DUF87  25 
 
 
520 aa  76.3  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0231678  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1871  hypothetical protein  26.32 
 
 
550 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1312  protein of unknown function DUF87  23.5 
 
 
911 aa  75.1  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00374873  unclonable  0.0000000332559 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0511  hypothetical protein  25.8 
 
 
497 aa  74.7  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1243  hypothetical protein  25.38 
 
 
510 aa  74.3  0.000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0577  hypothetical protein  26.45 
 
 
493 aa  73.9  0.000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0911  ATPase-like protein  20.5 
 
 
989 aa  71.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  23.32 
 
 
524 aa  70.9  0.00000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1803  hypothetical protein  25.94 
 
 
626 aa  71.2  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.321314  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1825  ATPase-like protein  34.19 
 
 
1065 aa  70.5  0.00000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.071271 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06795  hypothetical protein  24.86 
 
 
516 aa  70.1  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.207511  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  30.67 
 
 
608 aa  69.7  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1716  ATPase-like protein  33.33 
 
 
1065 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00601254 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0983  hypothetical protein  33.33 
 
 
616 aa  68.2  0.0000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.495624  hitchhiker  0.0000164054 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0321  hypothetical protein  23.64 
 
 
499 aa  67  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1394  hypothetical protein  23.04 
 
 
559 aa  66.6  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1870  protein of unknown function DUF87  24.3 
 
 
559 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.853161  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5417  hypothetical protein  24.54 
 
 
1698 aa  66.6  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.265481  normal  0.989313 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0467  ATPase-like protein  20.49 
 
 
1034 aa  65.9  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5297  protein of unknown function DUF87  27.89 
 
 
563 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1553  conserved hypothetical protein  24.32 
 
 
998 aa  65.1  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1250  ATPase  28.81 
 
 
1040 aa  65.1  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.515643 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  23.88 
 
 
531 aa  65.1  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1978  AAA ATPase  28.57 
 
 
293 aa  65.1  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0494  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  24.53 
 
 
505 aa  65.5  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0343  hypothetical protein  23.64 
 
 
499 aa  64.3  0.000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1138  hypothetical protein  28.45 
 
 
902 aa  63.5  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0832  hypothetical protein  24.09 
 
 
1037 aa  63.2  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0842823  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4430  hypothetical protein  23.43 
 
 
495 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0934  ATPase-like  28.1 
 
 
1097 aa  62.4  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.39548  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1482  hypothetical protein  24.59 
 
 
546 aa  62  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.431628  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1089  hypothetical protein  22.11 
 
 
930 aa  62.4  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0247852  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0645  ATPase-like protein  20.24 
 
 
989 aa  62.8  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0074  hypothetical protein  22.67 
 
 
495 aa  61.6  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0871233  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0635  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  26.19 
 
 
513 aa  62  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1486  hypothetical protein  24.61 
 
 
560 aa  61.6  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  22.99 
 
 
523 aa  61.6  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0817  ATPase  23.12 
 
 
1039 aa  61.6  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.331244  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1849  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  25.3 
 
 
511 aa  61.2  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.892343  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0605  hypothetical protein  25.07 
 
 
569 aa  61.2  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.035358  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1624  protein of unknown function DUF87  28.22 
 
 
557 aa  61.2  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1273  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  23.54 
 
 
520 aa  61.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.50823  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1248  hypothetical protein  21.09 
 
 
617 aa  60.8  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.531682  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0236  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  23.65 
 
 
496 aa  60.8  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1133  hypothetical protein  29.1 
 
 
496 aa  60.8  0.00000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1138  hypothetical protein  28.57 
 
 
561 aa  60.8  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0937  hypothetical protein  30.97 
 
 
540 aa  60.8  0.00000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0147133  normal  0.254287 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1732  hypothetical protein  21.98 
 
 
524 aa  60.8  0.00000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000995714 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3313  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  22.79 
 
 
565 aa  60.8  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1626  hypothetical protein  26.04 
 
 
300 aa  60.5  0.00000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00633506  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1687  hypothetical protein  22.87 
 
 
546 aa  60.5  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1361  hypothetical protein  31.25 
 
 
523 aa  60.5  0.00000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26972  normal  0.0191854 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2640  hypothetical protein  23.37 
 
 
569 aa  59.7  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1070  hypothetical protein  23.9 
 
 
452 aa  60.1  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4332  hypothetical protein  27.61 
 
 
427 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0816  hypothetical protein  22.71 
 
 
452 aa  59.3  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.723695  normal  0.916322 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2768  hypothetical protein  24.23 
 
 
508 aa  58.2  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.410021 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1508  hypothetical protein  21.34 
 
 
584 aa  58.2  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.496743  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2094  hypothetical protein  22.72 
 
 
582 aa  57.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5437  ATPase-like protein  27.5 
 
 
1143 aa  57  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.384057  normal  0.0313008 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5753  hypothetical protein  22.47 
 
 
612 aa  57  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.985257  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1372  hypothetical protein  22.97 
 
 
491 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.66471 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2465  protein of unknown function DUF87  23.44 
 
 
600 aa  56.2  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1283  hypothetical protein  24.37 
 
 
517 aa  56.2  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.608046  normal  0.929249 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4442  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  22.97 
 
 
491 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.905304  hitchhiker  0.0000193157 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4351  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  22.69 
 
 
491 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.012441 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4054  protein of unknown function DUF87  28.49 
 
 
709 aa  56.2  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0459328  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3308  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  22.5 
 
 
494 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1701  hypothetical protein  24.51 
 
 
539 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.016697  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2533  protein of unknown function DUF87  23.28 
 
 
674 aa  55.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3545  hypothetical protein  21.9 
 
 
544 aa  55.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652004  normal  0.57462 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3687  hypothetical protein  32.46 
 
 
594 aa  55.1  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0286808  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25990  predicted ATPase  22.95 
 
 
540 aa  55.1  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3183  hypothetical protein  26.75 
 
 
538 aa  54.7  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.837382  normal  0.234519 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  22.68 
 
 
524 aa  55.1  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1374  protein of unknown function DUF87  23.08 
 
 
538 aa  54.3  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.627609 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1012  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  23.21 
 
 
491 aa  54.7  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000194694 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1877  protein of unknown function DUF87  22.25 
 
 
560 aa  54.3  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2116  hypothetical protein  20.99 
 
 
583 aa  54.3  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.137689 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2366  protein of unknown function DUF87  26.77 
 
 
592 aa  54.3  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.250268  normal  0.14702 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2524  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  25.36 
 
 
478 aa  54.3  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.6508 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3200  ATPase-like protein  33.33 
 
 
659 aa  54.3  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4476  protein of unknown function DUF87  28.39 
 
 
593 aa  53.9  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3348  hypothetical protein  21.48 
 
 
628 aa  53.9  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989133  normal  0.0467064 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0203  protein of unknown function DUF87  31.93 
 
 
670 aa  53.9  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.187802 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1238  protein of unknown function DUF87  23.08 
 
 
575 aa  53.5  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0455  AAA ATPase  25.21 
 
 
295 aa  53.5  0.000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0676149  hitchhiker  0.0000338787 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>