49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1553 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1553  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 998 aa  2002    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0826  hypothetical protein  25.41 
 
 		 1734 aa  63.2  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0295  hypothetical protein  25 
 
 		 400 aa  62  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.690441  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1259  protein of unknown function DUF87  23.11 
 
 		 540 aa  61.6  0.00000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2263  ATPase-like protein  24.32 
 
 		 533 aa  60.5  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.539345 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  23.61 
 
 		 531 aa  60.1  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  22.89 
 
 		 496 aa  59.3  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0443  protein of unknown function DUF87  24.44 
 
 		 360 aa  58.5  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0177789  normal  0.220913 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4194  hypothetical protein  26.05 
 
 		 665 aa  58.5  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0224168 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2122  TraG family protein  22.13 
 
 		 464 aa  55.1  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0816  hypothetical protein  23.93 
 
 		 452 aa  53.9  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.723695  normal  0.916322 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0981  hypothetical protein  24.02 
 
 		 564 aa  53.5  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0983657  normal  0.0399667 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3794  TRAG protein  28.42 
 
 		 668 aa  53.1  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1088  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  30.97 
 
 		 1633 aa  52  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3988  TRAG family protein  28.42 
 
 		 670 aa  52  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.420427  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3655  TRAG family protein  28.42 
 
 		 667 aa  51.6  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.291322  decreased coverage  0.00000244512 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4079  hypothetical protein  23.28 
 
 		 876 aa  51.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00459285  normal  0.104503 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  22.14 
 
 		 605 aa  50.8  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0941  AAA ATPase  23.56 
 
 		 456 aa  50.4  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0685894 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0605  hypothetical protein  21.1 
 
 		 569 aa  50.4  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.035358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2467  TRAG family protein  20.78 
 
 		 511 aa  49.7  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.606871  hitchhiker  0.00000000721319 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1877  protein of unknown function DUF87  22.55 
 
 		 560 aa  49.7  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0837  DNA transfer in the process of conjugation and F pilus assembly protein  22.85 
 
 		 455 aa  49.7  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00362529  n/a   
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5297  protein of unknown function DUF87  23.93 
 
 		 563 aa  49.3  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1752  protein of unknown function DUF87  32.73 
 
 		 643 aa  49.7  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0738  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  21.94 
 
 		 557 aa  48.9  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1138  hypothetical protein  22.96 
 
 		 902 aa  48.9  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1344  hypothetical protein  22.7 
 
 		 451 aa  48.5  0.0006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0635  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  38.98 
 
 		 513 aa  48.1  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3905  hypothetical protein  28.72 
 
 		 760 aa  48.1  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2768  hypothetical protein  40 
 
 		 508 aa  47.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.410021 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4413  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  33.33 
 
 		 523 aa  47.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1133  hypothetical protein  23.59 
 
 		 496 aa  47.8  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1395  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  32.61 
 
 		 616 aa  47  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0290868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2211  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  32.61 
 
 		 618 aa  47  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1484  hypothetical protein  22.98 
 
 		 1144 aa  46.6  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0469742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2521  hypothetical protein  26.19 
 
 		 511 aa  46.2  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6944  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  31.65 
 
 		 702 aa  46.2  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0195  TraG family protein  22.1 
 
 		 457 aa  46.2  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1871  hypothetical protein  23.24 
 
 		 550 aa  45.8  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1783  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  42.86 
 
 		 555 aa  45.8  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000734669  normal  0.0773892 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1736  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  27.06 
 
 		 629 aa  45.8  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1716  ATPase-like protein  21 
 
 		 1065 aa  45.4  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00601254 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1204  hypothetical protein  39.06 
 
 		 527 aa  45.4  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0920  putative ATP-binding protein  21.2 
 
 		 1090 aa  45.4  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.061859  normal  0.0138151 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2074  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  24.81 
 
 		 526 aa  45.1  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.504817  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0786  hypothetical protein  25.4 
 
 		 511 aa  44.7  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0655509  normal  0.0950055 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2246  Type IV secretory pathway VirD4 components-like  28.46 
 
 		 506 aa  44.7  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25990  predicted ATPase  38.1 
 
 		 540 aa  44.7  0.009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>