41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4079 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2549  hypothetical protein  51.82 
 
 		 832 aa  673    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6850  type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  52.5 
 
 		 833 aa  686    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0108098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8580  type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  48 
 
 		 792 aa  638    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.384634  normal  0.281416 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4079  hypothetical protein  100 
 
 		 876 aa  1736    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00459285  normal  0.104503 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2745  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  51.32 
 
 		 841 aa  634  1e-180  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1694  Type IV secretory pathway VirD4 components-like  49.58 
 
 		 832 aa  634  1e-180  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000925009  normal  0.0597569 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6729  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  51.13 
 
 		 830 aa  630  1e-179  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.577691  normal  0.546954 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0906  Type IV secretory pathway VirD4 components-like  36.57 
 
 		 765 aa  263  8.999999999999999e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2068  hypothetical protein  38.54 
 
 		 728 aa  218  2.9999999999999998e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000291289  normal  0.0152831 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7330  type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  33.12 
 
 		 719 aa  204  6e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000633696  decreased coverage  0.00000000626768 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1436  hypothetical protein  36.69 
 
 		 737 aa  184  5.0000000000000004e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0188035  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0314  hypothetical protein  33.05 
 
 		 425 aa  176  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5953  hypothetical protein  28.85 
 
 		 751 aa  158  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5981  hypothetical protein  29.29 
 
 		 747 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5107  hypothetical protein  28.95 
 
 		 991 aa  140  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.286492  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0295  hypothetical protein  28.71 
 
 		 400 aa  138  6.0000000000000005e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.690441  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2031  hypothetical protein  34.39 
 
 		 205 aa  109  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3629  hypothetical protein  24.71 
 
 		 1276 aa  106  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0342  hypothetical protein  26.78 
 
 		 742 aa  100  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460096 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4007  hypothetical protein  27.01 
 
 		 976 aa  97.4  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.109226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0069  hypothetical protein  27.89 
 
 		 969 aa  97.1  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0314244  hitchhiker  0.0000262699 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3174  hypothetical protein  25.8 
 
 		 1009 aa  90.9  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0612  hypothetical protein  25.14 
 
 		 906 aa  69.7  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1027  hypothetical protein  24.17 
 
 		 791 aa  66.2  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2294  hypothetical protein  21.36 
 
 		 411 aa  63.2  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.147546  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2966  hypothetical protein  25.2 
 
 		 1187 aa  62.8  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1449  hypothetical protein  24.88 
 
 		 1319 aa  55.8  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.331748  normal  0.0633529 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2122  TraG family protein  22.86 
 
 		 464 aa  55.8  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5114  AAA ATPase  39.02 
 
 		 1076 aa  53.5  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078899 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1183  hypothetical protein  23.03 
 
 		 811 aa  52.8  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1553  conserved hypothetical protein  23.21 
 
 		 998 aa  51.2  0.00009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0837  DNA transfer in the process of conjugation and F pilus assembly protein  44.19 
 
 		 455 aa  50.1  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00362529  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2764  hypothetical protein  36.63 
 
 		 752 aa  47.4  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.656214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3017  hypothetical protein  31.07 
 
 		 828 aa  47  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0037  hypothetical protein  22.81 
 
 		 926 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0124  mobilization protein  21.93 
 
 		 635 aa  45.8  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.795434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0250  TraG family protein  34.25 
 
 		 457 aa  45.8  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0195  TraG family protein  34.25 
 
 		 457 aa  45.8  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3798  TraG family protein  40 
 
 		 470 aa  45.8  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2799  hypothetical protein  22.63 
 
 		 512 aa  44.7  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.500264  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2699  AAA ATPase  28.23 
 
 		 603 aa  44.3  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.480316  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>