39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2745 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2549  hypothetical protein  84.21 
 
 		 832 aa  1242    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1694  Type IV secretory pathway VirD4 components-like  83.97 
 
 		 832 aa  1221    Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000925009  normal  0.0597569 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2745  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  100 
 
 		 841 aa  1642    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4079  hypothetical protein  51.13 
 
 		 876 aa  654    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00459285  normal  0.104503 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6729  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  51.19 
 
 		 830 aa  600  1e-170  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.577691  normal  0.546954 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6850  type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  47.9 
 
 		 833 aa  601  1e-170  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0108098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8580  type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  44.06 
 
 		 792 aa  589  1e-167  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.384634  normal  0.281416 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2068  hypothetical protein  36.41 
 
 		 728 aa  223  9.999999999999999e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000291289  normal  0.0152831 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0906  Type IV secretory pathway VirD4 components-like  32.88 
 
 		 765 aa  221  5e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7330  type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  28.78 
 
 		 719 aa  173  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000633696  decreased coverage  0.00000000626768 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1436  hypothetical protein  33.77 
 
 		 737 aa  170  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0188035  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0314  hypothetical protein  30.13 
 
 		 425 aa  165  4.0000000000000004e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0295  hypothetical protein  29 
 
 		 400 aa  140  8.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.690441  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5953  hypothetical protein  28.61 
 
 		 751 aa  128  6e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5981  hypothetical protein  27.27 
 
 		 747 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4007  hypothetical protein  27.4 
 
 		 976 aa  103  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.109226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5107  hypothetical protein  25 
 
 		 991 aa  100  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.286492  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0069  hypothetical protein  28.6 
 
 		 969 aa  92.8  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0314244  hitchhiker  0.0000262699 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2031  hypothetical protein  33.54 
 
 		 205 aa  90.5  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0342  hypothetical protein  25.3 
 
 		 742 aa  89.4  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460096 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3629  hypothetical protein  22.4 
 
 		 1276 aa  85.9  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3174  hypothetical protein  23.59 
 
 		 1009 aa  69.7  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0612  hypothetical protein  24.13 
 
 		 906 aa  65.1  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0297  hypothetical protein  29.56 
 
 		 1123 aa  64.3  0.000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1449  hypothetical protein  24.64 
 
 		 1319 aa  61.6  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.331748  normal  0.0633529 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1027  hypothetical protein  22.57 
 
 		 791 aa  59.7  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2966  hypothetical protein  25.14 
 
 		 1187 aa  51.6  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0064  TraG/TraD family conjugal transfer protein  28.06 
 
 		 1109 aa  48.5  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0064  conjugation protein, TraG/TraD family  28.06 
 
 		 1166 aa  47.8  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0093  conjugation protein, TraG/TraD family  28.06 
 
 		 1166 aa  47.8  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0073  TraG/TraD family protein  28.06 
 
 		 1166 aa  47.8  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0037  hypothetical protein  20.89 
 
 		 926 aa  47  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6396  TRAG family protein  28 
 
 		 699 aa  45.8  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.969912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4169  TRAG protein  27.33 
 
 		 678 aa  45.4  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3017  hypothetical protein  29.75 
 
 		 828 aa  45.1  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0250  TraG family protein  37.5 
 
 		 457 aa  44.7  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0066  type IV conjugative transfer system protein TraD  21.88 
 
 		 621 aa  44.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0195  TraG family protein  37.5 
 
 		 457 aa  44.7  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0467  ATPase-like protein  24.93 
 
 		 1034 aa  44.3  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.634618 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>