14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0297 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0297  hypothetical protein  100 
 
 		 1123 aa  2302    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0342  hypothetical protein  28.72 
 
 		 742 aa  130  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460096 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2549  hypothetical protein  24.73 
 
 		 832 aa  71.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1694  Type IV secretory pathway VirD4 components-like  22.49 
 
 		 832 aa  68.6  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000925009  normal  0.0597569 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2745  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  29.56 
 
 		 841 aa  65.1  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2015  chaperone DnaJ  28.57 
 
 		 333 aa  51.6  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0999133  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2580  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.43 
 
 		 629 aa  50.8  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.294872 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1436  hypothetical protein  24.15 
 
 		 737 aa  49.3  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0188035  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5953  hypothetical protein  22.85 
 
 		 751 aa  48.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1877  protein of unknown function DUF87  35.48 
 
 		 560 aa  47.8  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6729  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  26.51 
 
 		 830 aa  47.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.577691  normal  0.546954 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6850  type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  21.37 
 
 		 833 aa  47.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0108098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0918  heat shock protein DnaJ-like  26.17 
 
 		 333 aa  45.1  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.555506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8580  type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  25.14 
 
 		 792 aa  45.4  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.384634  normal  0.281416 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>