45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5953 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_5981  hypothetical protein  80.11 
 
 		 747 aa  1181    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5953  hypothetical protein  100 
 
 		 751 aa  1510    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1027  hypothetical protein  27.53 
 
 		 791 aa  177  5e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4079  hypothetical protein  28.85 
 
 		 876 aa  157  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00459285  normal  0.104503 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8580  type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  30.07 
 
 		 792 aa  146  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.384634  normal  0.281416 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6729  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  29.62 
 
 		 830 aa  142  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.577691  normal  0.546954 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1694  Type IV secretory pathway VirD4 components-like  30.23 
 
 		 832 aa  140  8.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000925009  normal  0.0597569 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2549  hypothetical protein  29.43 
 
 		 832 aa  137  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7330  type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  30 
 
 		 719 aa  132  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000633696  decreased coverage  0.00000000626768 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6850  type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  29.02 
 
 		 833 aa  132  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0108098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0314  hypothetical protein  26.52 
 
 		 425 aa  131  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2068  hypothetical protein  30.34 
 
 		 728 aa  130  7.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000291289  normal  0.0152831 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2745  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  28.61 
 
 		 841 aa  127  8.000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0906  Type IV secretory pathway VirD4 components-like  27.64 
 
 		 765 aa  124  8e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0295  hypothetical protein  27.76 
 
 		 400 aa  114  6e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.690441  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1436  hypothetical protein  25.34 
 
 		 737 aa  84  0.000000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0188035  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3629  hypothetical protein  22.81 
 
 		 1276 aa  75.5  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4007  hypothetical protein  24.52 
 
 		 976 aa  72.8  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.109226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0612  hypothetical protein  23.69 
 
 		 906 aa  72.4  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5107  hypothetical protein  22.49 
 
 		 991 aa  70.9  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.286492  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3174  hypothetical protein  25.53 
 
 		 1009 aa  70.1  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1183  hypothetical protein  22.05 
 
 		 811 aa  68.6  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  26.09 
 
 		 531 aa  67.4  0.0000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0342  hypothetical protein  21.82 
 
 		 742 aa  65.5  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460096 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2031  hypothetical protein  31.61 
 
 		 205 aa  65.1  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1689  conjugation protein  24.71 
 
 		 1342 aa  64.3  0.000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0069  hypothetical protein  24.86 
 
 		 969 aa  63.5  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0314244  hitchhiker  0.0000262699 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0070  protein of unknown function DUF87  23.26 
 
 		 500 aa  63.2  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0037  hypothetical protein  22.83 
 
 		 926 aa  55.8  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4994  hypothetical protein  36.84 
 
 		 1510 aa  54.7  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.238076  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2294  hypothetical protein  20.92 
 
 		 411 aa  53.9  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.147546  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2966  hypothetical protein  23.71 
 
 		 1187 aa  52.4  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3242  hypothetical protein  23.27 
 
 		 612 aa  48.9  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0135  protein of unknown function DUF87  25.07 
 
 		 520 aa  48.5  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0231678  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2263  ATPase-like protein  30.34 
 
 		 533 aa  48.1  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.539345 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0297  hypothetical protein  22.85 
 
 		 1123 aa  47.8  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0467  ATPase-like protein  24.23 
 
 		 1034 aa  46.6  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0760  hypothetical protein  24.59 
 
 		 492 aa  46.2  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.360251  normal  0.0367515 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3798  TraG family protein  22.57 
 
 		 470 aa  45.4  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0064  TraG/TraD family conjugal transfer protein  28.57 
 
 		 1109 aa  44.7  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0064  conjugation protein, TraG/TraD family  28.57 
 
 		 1166 aa  44.3  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0093  conjugation protein, TraG/TraD family  28.57 
 
 		 1166 aa  44.3  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0073  TraG/TraD family protein  28.57 
 
 		 1166 aa  44.3  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  30.13 
 
 		 679 aa  44.3  0.009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0221  TraG/TraD family conjugal transfer protein  29.13 
 
 		 1025 aa  43.9  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>