30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3629 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012030  Hlac_3629  hypothetical protein  100 
 
 		 1276 aa  2653    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3174  hypothetical protein  36.16 
 
 		 1009 aa  290  1e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3175  hypothetical protein  27.56 
 
 		 375 aa  139  3.0000000000000003e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4079  hypothetical protein  24.65 
 
 		 876 aa  108  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00459285  normal  0.104503 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0314  hypothetical protein  23.79 
 
 		 425 aa  105  7e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6729  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  22.12 
 
 		 830 aa  100  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.577691  normal  0.546954 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6850  type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  23.98 
 
 		 833 aa  95.1  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0108098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2068  hypothetical protein  25.84 
 
 		 728 aa  92  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000291289  normal  0.0152831 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5107  hypothetical protein  23.99 
 
 		 991 aa  91.3  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.286492  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8580  type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  23.41 
 
 		 792 aa  89  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.384634  normal  0.281416 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0906  Type IV secretory pathway VirD4 components-like  22.45 
 
 		 765 aa  87  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2745  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  22.11 
 
 		 841 aa  85.5  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2549  hypothetical protein  22.22 
 
 		 832 aa  84.7  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5981  hypothetical protein  23.27 
 
 		 747 aa  84  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7330  type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  22.97 
 
 		 719 aa  83.2  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000633696  decreased coverage  0.00000000626768 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1694  Type IV secretory pathway VirD4 components-like  22.22 
 
 		 832 aa  80.9  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000925009  normal  0.0597569 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5953  hypothetical protein  23.34 
 
 		 751 aa  77.8  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1436  hypothetical protein  24.65 
 
 		 737 aa  68.2  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0188035  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2031  hypothetical protein  31.62 
 
 		 205 aa  66.2  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2122  TraG family protein  26.5 
 
 		 464 aa  60.1  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0342  hypothetical protein  25.53 
 
 		 742 aa  59.3  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460096 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0612  hypothetical protein  21.89 
 
 		 906 aa  57.8  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3600  integrase family protein  52.38 
 
 		 201 aa  55.8  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2818  TATA-box binding family protein  100 
 
 		 123 aa  53.1  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0250  TraG family protein  37.14 
 
 		 457 aa  51.6  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0195  TraG family protein  37.14 
 
 		 457 aa  51.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0361  sex pilus assembly and mating pair formation  21.11 
 
 		 589 aa  50.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.398823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0652  putative type IV secretory pathway VirD4 components  21.21 
 
 		 602 aa  48.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1482  hypothetical protein  25.14 
 
 		 546 aa  46.6  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.431628  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0837  DNA transfer in the process of conjugation and F pilus assembly protein  36.84 
 
 		 455 aa  45.8  0.006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00362529  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>