34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3174 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012028  Hlac_3174  hypothetical protein  100 
 
 		 1009 aa  2063    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1689  conjugation protein  36.21 
 
 		 1342 aa  362  3e-98  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3629  hypothetical protein  36.16 
 
 		 1276 aa  315  1.9999999999999998e-84  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0906  Type IV secretory pathway VirD4 components-like  26.11 
 
 		 765 aa  124  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6729  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  26.25 
 
 		 830 aa  122  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.577691  normal  0.546954 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4079  hypothetical protein  26.04 
 
 		 876 aa  117  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00459285  normal  0.104503 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7330  type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  24.77 
 
 		 719 aa  105  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000633696  decreased coverage  0.00000000626768 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5107  hypothetical protein  25.07 
 
 		 991 aa  96.3  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.286492  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6850  type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  25.45 
 
 		 833 aa  93.2  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0108098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5953  hypothetical protein  25.72 
 
 		 751 aa  91.3  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2549  hypothetical protein  24.34 
 
 		 832 aa  90.9  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1694  Type IV secretory pathway VirD4 components-like  24.07 
 
 		 832 aa  90.1  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000925009  normal  0.0597569 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0295  hypothetical protein  24.75 
 
 		 400 aa  88.2  7e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.690441  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2745  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  23.18 
 
 		 841 aa  88.2  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0314  hypothetical protein  22.78 
 
 		 425 aa  83.2  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8580  type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  23.81 
 
 		 792 aa  82  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.384634  normal  0.281416 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1436  hypothetical protein  23.82 
 
 		 737 aa  78.2  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0188035  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2068  hypothetical protein  24.49 
 
 		 728 aa  77.8  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000291289  normal  0.0152831 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5981  hypothetical protein  24.78 
 
 		 747 aa  74.3  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1553  conserved hypothetical protein  22.49 
 
 		 998 aa  65.1  0.000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2966  hypothetical protein  22.02 
 
 		 1187 aa  61.6  0.00000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4994  hypothetical protein  21.41 
 
 		 1510 aa  61.2  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.238076  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0068  TraG/TraD family conjugal transfer protein  22.14 
 
 		 762 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0076  trbC protein  22.14 
 
 		 762 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2122  TraG family protein  22.79 
 
 		 464 aa  52.8  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1027  hypothetical protein  19.58 
 
 		 791 aa  52  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2031  hypothetical protein  29.82 
 
 		 205 aa  52  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0612  hypothetical protein  21.22 
 
 		 906 aa  51.6  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4007  hypothetical protein  22.92 
 
 		 976 aa  51.2  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.109226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0069  hypothetical protein  22.96 
 
 		 969 aa  48.5  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0314244  hitchhiker  0.0000262699 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1183  hypothetical protein  19.21 
 
 		 811 aa  47.8  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0195  TraG family protein  31.63 
 
 		 457 aa  46.6  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0250  TraG family protein  31.63 
 
 		 457 aa  45.8  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1825  ATPase-like protein  31.51 
 
 		 1065 aa  44.7  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.071271 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>