38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8580 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8580  type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  100 
 
 		 792 aa  1580    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.384634  normal  0.281416 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6850  type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  52.53 
 
 		 833 aa  719    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0108098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4079  hypothetical protein  47.84 
 
 		 876 aa  617  1e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00459285  normal  0.104503 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2549  hypothetical protein  45.21 
 
 		 832 aa  555  1e-156  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2745  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  45.73 
 
 		 841 aa  550  1e-155  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6729  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  47.62 
 
 		 830 aa  532  1e-150  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.577691  normal  0.546954 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1694  Type IV secretory pathway VirD4 components-like  43.73 
 
 		 832 aa  524  1e-147  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000925009  normal  0.0597569 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0906  Type IV secretory pathway VirD4 components-like  34.03 
 
 		 765 aa  228  3e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2068  hypothetical protein  37.73 
 
 		 728 aa  207  8e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000291289  normal  0.0152831 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7330  type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  29.66 
 
 		 719 aa  188  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000633696  decreased coverage  0.00000000626768 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1436  hypothetical protein  32.85 
 
 		 737 aa  160  8e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0188035  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0314  hypothetical protein  32.02 
 
 		 425 aa  154  5.9999999999999996e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5953  hypothetical protein  30.07 
 
 		 751 aa  146  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5981  hypothetical protein  28.94 
 
 		 747 aa  125  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0295  hypothetical protein  28.96 
 
 		 400 aa  123  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.690441  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5107  hypothetical protein  27.86 
 
 		 991 aa  102  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.286492  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0069  hypothetical protein  28.77 
 
 		 969 aa  100  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0314244  hitchhiker  0.0000262699 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4007  hypothetical protein  26.83 
 
 		 976 aa  92  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.109226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0342  hypothetical protein  26.61 
 
 		 742 aa  89.7  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460096 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3629  hypothetical protein  23.28 
 
 		 1276 aa  86.7  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1027  hypothetical protein  25.86 
 
 		 791 aa  75.5  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2031  hypothetical protein  30.77 
 
 		 205 aa  72.8  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1449  hypothetical protein  26.29 
 
 		 1319 aa  69.7  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.331748  normal  0.0633529 
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0037  hypothetical protein  22.9 
 
 		 926 aa  66.6  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3174  hypothetical protein  23.56 
 
 		 1009 aa  66.2  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2294  hypothetical protein  21.85 
 
 		 411 aa  60.8  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.147546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0612  hypothetical protein  22.5 
 
 		 906 aa  58.9  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2966  hypothetical protein  26.43 
 
 		 1187 aa  57.4  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0064  TraG/TraD family conjugal transfer protein  30.43 
 
 		 1109 aa  53.5  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0064  conjugation protein, TraG/TraD family  30.43 
 
 		 1166 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0093  conjugation protein, TraG/TraD family  30.43 
 
 		 1166 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0073  TraG/TraD family protein  30.43 
 
 		 1166 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3798  TraG family protein  25.41 
 
 		 470 aa  52.4  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2122  TraG family protein  21.25 
 
 		 464 aa  47.8  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1183  hypothetical protein  21.31 
 
 		 811 aa  47  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3017  hypothetical protein  31.19 
 
 		 828 aa  46.2  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3242  hypothetical protein  22.44 
 
 		 612 aa  44.7  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0297  hypothetical protein  25.14 
 
 		 1123 aa  44.7  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>