20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3242 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_3242  hypothetical protein  100 
 
 
612 aa  1251    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0361  sex pilus assembly and mating pair formation  29.25 
 
 
589 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.398823  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0738  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  22.76 
 
 
557 aa  70.9  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1251  lipoprotein, putative  22.49 
 
 
619 aa  66.2  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.684077  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0057  hypothetical protein  25.59 
 
 
952 aa  62  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.889998  hitchhiker  0.00629192 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1016  hypothetical protein  22.45 
 
 
644 aa  59.7  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1055  hypothetical protein  35.87 
 
 
659 aa  53.5  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5981  hypothetical protein  23.05 
 
 
747 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2398  hypothetical protein  21.57 
 
 
668 aa  52.8  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0124  mobilization protein  24.74 
 
 
635 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.795434  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5953  hypothetical protein  23.27 
 
 
751 aa  48.9  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7330  type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  27.74 
 
 
719 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000633696  decreased coverage  0.00000000626768 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0068  TraG/TraD family conjugal transfer protein  21.19 
 
 
762 aa  45.8  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0076  trbC protein  21.04 
 
 
762 aa  46.2  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6729  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  24.56 
 
 
830 aa  45.4  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.577691  normal  0.546954 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8580  type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  23.36 
 
 
792 aa  44.7  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.384634  normal  0.281416 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0122  putative type IV secretion system protein IcmO/DotL  28.28 
 
 
934 aa  44.3  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1816  IcmO protein  34.62 
 
 
792 aa  43.9  0.009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0488  hypothetical protein  32.58 
 
 
783 aa  43.5  0.01  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0512  hypothetical protein  32.58 
 
 
783 aa  43.9  0.01  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>