23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1027 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1027  hypothetical protein  100 
 
 		 791 aa  1565    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5953  hypothetical protein  28.05 
 
 		 751 aa  183  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5981  hypothetical protein  28.02 
 
 		 747 aa  177  9e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6729  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  26.47 
 
 		 830 aa  94.4  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.577691  normal  0.546954 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0314  hypothetical protein  24.14 
 
 		 425 aa  92  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0295  hypothetical protein  26.9 
 
 		 400 aa  85.5  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.690441  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0906  Type IV secretory pathway VirD4 components-like  25 
 
 		 765 aa  79.7  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8580  type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  25.86 
 
 		 792 aa  75.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.384634  normal  0.281416 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2068  hypothetical protein  25.99 
 
 		 728 aa  74.3  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000291289  normal  0.0152831 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7330  type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  24.72 
 
 		 719 aa  74.3  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000633696  decreased coverage  0.00000000626768 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6850  type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  23.34 
 
 		 833 aa  73.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0108098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0037  hypothetical protein  23.9 
 
 		 926 aa  67  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4079  hypothetical protein  24.17 
 
 		 876 aa  65.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00459285  normal  0.104503 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1183  hypothetical protein  24.13 
 
 		 811 aa  65.5  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1436  hypothetical protein  23.08 
 
 		 737 aa  64.7  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0188035  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0612  hypothetical protein  26.24 
 
 		 906 aa  63.5  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2745  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  22.57 
 
 		 841 aa  58.9  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0342  hypothetical protein  27.94 
 
 		 742 aa  58.5  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460096 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2549  hypothetical protein  22.66 
 
 		 832 aa  52  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1694  Type IV secretory pathway VirD4 components-like  21.31 
 
 		 832 aa  48.9  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000925009  normal  0.0597569 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2966  hypothetical protein  24.62 
 
 		 1187 aa  47.4  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1877  protein of unknown function DUF87  25.81 
 
 		 560 aa  45.1  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0297  hypothetical protein  25.75 
 
 		 1123 aa  44.3  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>