19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2966 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012028  Hlac_2966  hypothetical protein  100 
 
 		 1187 aa  2393    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1689  conjugation protein  32.56 
 
 		 1342 aa  387  1e-106  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4994  hypothetical protein  28.73 
 
 		 1510 aa  313  1e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.238076  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0612  hypothetical protein  23.85 
 
 		 906 aa  86.7  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4079  hypothetical protein  25.2 
 
 		 876 aa  62.4  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00459285  normal  0.104503 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6729  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  26.27 
 
 		 830 aa  58.9  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.577691  normal  0.546954 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3174  hypothetical protein  26.8 
 
 		 1009 aa  57.8  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8580  type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  26.43 
 
 		 792 aa  57  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.384634  normal  0.281416 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5981  hypothetical protein  25.49 
 
 		 747 aa  54.3  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7330  type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  24.55 
 
 		 719 aa  53.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000633696  decreased coverage  0.00000000626768 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0342  hypothetical protein  22.75 
 
 		 742 aa  53.1  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460096 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1694  Type IV secretory pathway VirD4 components-like  26.36 
 
 		 832 aa  51.6  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000925009  normal  0.0597569 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2745  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  25.14 
 
 		 841 aa  50.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1877  protein of unknown function DUF87  24.18 
 
 		 560 aa  48.5  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2549  hypothetical protein  25.57 
 
 		 832 aa  47  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0906  Type IV secretory pathway VirD4 components-like  25.93 
 
 		 765 aa  46.2  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1027  hypothetical protein  31.37 
 
 		 791 aa  45.8  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1449  hypothetical protein  28.65 
 
 		 1319 aa  45.1  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.331748  normal  0.0633529 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4330  hypothetical protein  25.7 
 
 		 637 aa  44.7  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.930628  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>