33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7330 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7330  type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  100 
 
 		 719 aa  1433    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000633696  decreased coverage  0.00000000626768 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2068  hypothetical protein  32.84 
 
 		 728 aa  264  3e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000291289  normal  0.0152831 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0906  Type IV secretory pathway VirD4 components-like  33.33 
 
 		 765 aa  251  4e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1436  hypothetical protein  29.44 
 
 		 737 aa  225  2e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0188035  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6729  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  35.66 
 
 		 830 aa  211  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.577691  normal  0.546954 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4079  hypothetical protein  29.7 
 
 		 876 aa  204  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00459285  normal  0.104503 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2549  hypothetical protein  32.34 
 
 		 832 aa  191  4e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1694  Type IV secretory pathway VirD4 components-like  32.13 
 
 		 832 aa  189  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000925009  normal  0.0597569 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8580  type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  29.66 
 
 		 792 aa  188  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.384634  normal  0.281416 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6850  type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  32.08 
 
 		 833 aa  183  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0108098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2745  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  28.84 
 
 		 841 aa  172  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0314  hypothetical protein  29.72 
 
 		 425 aa  145  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5953  hypothetical protein  30 
 
 		 751 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0295  hypothetical protein  27.61 
 
 		 400 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.690441  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5981  hypothetical protein  29.1 
 
 		 747 aa  107  7e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5107  hypothetical protein  25.52 
 
 		 991 aa  102  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.286492  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4007  hypothetical protein  27.55 
 
 		 976 aa  91.7  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.109226  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3174  hypothetical protein  25.11 
 
 		 1009 aa  91.3  6e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0069  hypothetical protein  27.02 
 
 		 969 aa  89.7  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0314244  hitchhiker  0.0000262699 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2031  hypothetical protein  35.94 
 
 		 205 aa  82  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3629  hypothetical protein  22.97 
 
 		 1276 aa  80.5  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1449  hypothetical protein  25.94 
 
 		 1319 aa  74.7  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.331748  normal  0.0633529 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1027  hypothetical protein  24.72 
 
 		 791 aa  73.9  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0342  hypothetical protein  22.03 
 
 		 742 aa  65.9  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460096 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0221  TraG/TraD family conjugal transfer protein  29.87 
 
 		 1025 aa  55.1  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2966  hypothetical protein  24.55 
 
 		 1187 aa  53.9  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0016  hypothetical protein  21.58 
 
 		 852 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  0.102628 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0612  hypothetical protein  22.03 
 
 		 906 aa  53.5  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1689  conjugation protein  22.69 
 
 		 1342 aa  52.8  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1183  hypothetical protein  21.32 
 
 		 811 aa  50.1  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0037  hypothetical protein  20.82 
 
 		 926 aa  48.9  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2122  TraG family protein  20.17 
 
 		 464 aa  48.1  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3242  hypothetical protein  27.74 
 
 		 612 aa  46.6  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>