45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5981 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_5981  hypothetical protein  100 
 
 		 747 aa  1495    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5953  hypothetical protein  80.11 
 
 		 751 aa  1213    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1027  hypothetical protein  28.12 
 
 		 791 aa  172  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4079  hypothetical protein  29.29 
 
 		 876 aa  144  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00459285  normal  0.104503 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0314  hypothetical protein  26.98 
 
 		 425 aa  138  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6729  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  30.26 
 
 		 830 aa  132  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.577691  normal  0.546954 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1694  Type IV secretory pathway VirD4 components-like  29.09 
 
 		 832 aa  126  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000925009  normal  0.0597569 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8580  type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  29.29 
 
 		 792 aa  126  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.384634  normal  0.281416 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2549  hypothetical protein  27.79 
 
 		 832 aa  125  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2745  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  27.27 
 
 		 841 aa  120  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0906  Type IV secretory pathway VirD4 components-like  26.92 
 
 		 765 aa  116  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6850  type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  28 
 
 		 833 aa  116  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0108098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2068  hypothetical protein  30.07 
 
 		 728 aa  114  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000291289  normal  0.0152831 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0295  hypothetical protein  27.15 
 
 		 400 aa  114  7.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.690441  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7330  type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  29.1 
 
 		 719 aa  107  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000633696  decreased coverage  0.00000000626768 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3629  hypothetical protein  23.46 
 
 		 1276 aa  84  0.000000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4007  hypothetical protein  25.47 
 
 		 976 aa  75.1  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.109226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1436  hypothetical protein  25.68 
 
 		 737 aa  74.3  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0188035  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1183  hypothetical protein  23.1 
 
 		 811 aa  69.7  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0342  hypothetical protein  24.09 
 
 		 742 aa  68.6  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460096 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0069  hypothetical protein  25.81 
 
 		 969 aa  68.6  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0314244  hitchhiker  0.0000262699 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1689  conjugation protein  25.24 
 
 		 1342 aa  67.4  0.0000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0612  hypothetical protein  22.19 
 
 		 906 aa  65.9  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2031  hypothetical protein  29.14 
 
 		 205 aa  65.1  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.671981 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0070  protein of unknown function DUF87  22.79 
 
 		 500 aa  60.1  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  26.04 
 
 		 531 aa  58.9  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3174  hypothetical protein  29.41 
 
 		 1009 aa  57.8  0.0000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2294  hypothetical protein  21.81 
 
 		 411 aa  55.8  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.147546  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2966  hypothetical protein  25.49 
 
 		 1187 aa  55.5  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4994  hypothetical protein  36.84 
 
 		 1510 aa  54.3  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.238076  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3242  hypothetical protein  23.05 
 
 		 612 aa  53.9  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3798  TraG family protein  22.25 
 
 		 470 aa  53.5  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5107  hypothetical protein  22.88 
 
 		 991 aa  50.8  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.286492  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2122  TraG family protein  24.11 
 
 		 464 aa  49.7  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0135  protein of unknown function DUF87  24.85 
 
 		 520 aa  48.9  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0231678  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0037  hypothetical protein  22.42 
 
 		 926 aa  48.9  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1877  protein of unknown function DUF87  22.7 
 
 		 560 aa  48.9  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0064  TraG/TraD family conjugal transfer protein  29.36 
 
 		 1109 aa  46.2  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0221  TraG/TraD family conjugal transfer protein  30.1 
 
 		 1025 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0467  ATPase-like protein  24.49 
 
 		 1034 aa  46.6  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0064  conjugation protein, TraG/TraD family  29.36 
 
 		 1166 aa  45.1  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0093  conjugation protein, TraG/TraD family  29.36 
 
 		 1166 aa  45.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0073  TraG/TraD family protein  29.36 
 
 		 1166 aa  45.1  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2263  ATPase-like protein  33.77 
 
 		 533 aa  44.3  0.009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.539345 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4332  hypothetical protein  27.56 
 
 		 427 aa  44.3  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>