29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0612 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_0612  hypothetical protein  100 
 
 
906 aa  1851    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0037  hypothetical protein  31.94 
 
 
926 aa  267  7e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1183  hypothetical protein  33.8 
 
 
811 aa  252  2e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2966  hypothetical protein  23.85 
 
 
1187 aa  87  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6729  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  26.27 
 
 
830 aa  82.4  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.577691  normal  0.546954 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5953  hypothetical protein  23.69 
 
 
751 aa  72  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2068  hypothetical protein  25.21 
 
 
728 aa  69.3  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000291289  normal  0.0152831 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4079  hypothetical protein  25.14 
 
 
876 aa  69.7  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00459285  normal  0.104503 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1689  conjugation protein  23.06 
 
 
1342 aa  68.2  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5107  hypothetical protein  24.84 
 
 
991 aa  68.2  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.286492  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5981  hypothetical protein  27.71 
 
 
747 aa  65.5  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2745  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  24.13 
 
 
841 aa  64.7  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325821  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0314  hypothetical protein  22.25 
 
 
425 aa  64.3  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1027  hypothetical protein  26.24 
 
 
791 aa  63.5  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6850  type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  21.91 
 
 
833 aa  59.3  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0108098  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8580  type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  22.73 
 
 
792 aa  58.9  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.384634  normal  0.281416 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3629  hypothetical protein  21.03 
 
 
1276 aa  57.8  0.0000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7330  type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  22.03 
 
 
719 aa  53.5  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000633696  decreased coverage  0.00000000626768 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1436  hypothetical protein  24.14 
 
 
737 aa  52  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0188035  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1877  protein of unknown function DUF87  27.49 
 
 
560 aa  51.2  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  24.56 
 
 
508 aa  51.2  0.00009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0645  ATPase-like protein  21.39 
 
 
989 aa  49.3  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3174  hypothetical protein  21.5 
 
 
1009 aa  47  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4994  hypothetical protein  21.01 
 
 
1510 aa  46.2  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.238076  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0934  ATPase-like  23.1 
 
 
1097 aa  45.8  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.39548  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1359  hypothetical protein  22.78 
 
 
570 aa  45.1  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.997931 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1361  hypothetical protein  26.85 
 
 
523 aa  45.1  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26972  normal  0.0191854 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1732  hypothetical protein  29.17 
 
 
524 aa  44.3  0.01  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000995714 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  28.97 
 
 
557 aa  44.3  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>