31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1183 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_1183  hypothetical protein  100 
 
 
811 aa  1671    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0612  hypothetical protein  33.67 
 
 
906 aa  252  2e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0037  hypothetical protein  26.83 
 
 
926 aa  229  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0314  hypothetical protein  22.81 
 
 
425 aa  73.6  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5981  hypothetical protein  23.1 
 
 
747 aa  68.9  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5953  hypothetical protein  22.05 
 
 
751 aa  68.6  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1027  hypothetical protein  24.13 
 
 
791 aa  65.5  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2533  protein of unknown function DUF87  23.92 
 
 
674 aa  62  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2804  hypothetical protein  24.93 
 
 
693 aa  60.1  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0342  hypothetical protein  24.18 
 
 
742 aa  58.2  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.460096 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5107  hypothetical protein  23.36 
 
 
991 aa  56.2  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.286492  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2792  protein of unknown function DUF87  23.86 
 
 
679 aa  56.2  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.744858  normal  0.636348 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6850  type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  23.9 
 
 
833 aa  55.1  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0108098  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1732  hypothetical protein  27.38 
 
 
524 aa  55.1  0.000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000995714 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2009  hypothetical protein  23.33 
 
 
662 aa  54.3  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184515  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3545  hypothetical protein  22.74 
 
 
544 aa  53.1  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652004  normal  0.57462 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4079  hypothetical protein  23.38 
 
 
876 aa  52.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00459285  normal  0.104503 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6729  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  23.91 
 
 
830 aa  51.6  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.577691  normal  0.546954 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2640  hypothetical protein  21.29 
 
 
569 aa  51.2  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0605  hypothetical protein  21.64 
 
 
569 aa  51.2  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.035358  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1694  Type IV secretory pathway VirD4 components-like  24.43 
 
 
832 aa  50.1  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000925009  normal  0.0597569 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2356  hypothetical protein  29.23 
 
 
603 aa  50.1  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7330  type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  21.32 
 
 
719 aa  50.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000633696  decreased coverage  0.00000000626768 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1361  hypothetical protein  26.4 
 
 
523 aa  48.9  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26972  normal  0.0191854 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  22.42 
 
 
523 aa  47.8  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8580  type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  21.31 
 
 
792 aa  47  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.384634  normal  0.281416 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0295  hypothetical protein  27.42 
 
 
400 aa  47.4  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.690441  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3750  hypothetical protein  21.86 
 
 
635 aa  45.8  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.294412 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  22.42 
 
 
524 aa  45.8  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1689  conjugation protein  29.14 
 
 
1342 aa  45.8  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  22.3 
 
 
679 aa  44.7  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>