45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6850 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8580  type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  53.13 
 
 		 792 aa  757    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.384634  normal  0.281416 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4079  hypothetical protein  52.92 
 
 		 876 aa  691    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00459285  normal  0.104503 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6850  type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  100 
 
 		 833 aa  1646    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0108098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2549  hypothetical protein  48.92 
 
 		 832 aa  605  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2745  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  48.86 
 
 		 841 aa  597  1e-169  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1694  Type IV secretory pathway VirD4 components-like  46.3 
 
 		 832 aa  574  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000925009  normal  0.0597569 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6729  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  48.6 
 
 		 830 aa  570  1e-161  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.577691  normal  0.546954 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0906  Type IV secretory pathway VirD4 components-like  37.27 
 
 		 765 aa  247  6e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2068  hypothetical protein  40.26 
 
 		 728 aa  224  4e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000291289  normal  0.0152831 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7330  type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  32.78 
 
 		 719 aa  194  8e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000633696  decreased coverage  0.00000000626768 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0314  hypothetical protein  32.55 
 
 		 425 aa  168  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1436  hypothetical protein  33.5 
 
 		 737 aa  167  6.9999999999999995e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0188035  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5953  hypothetical protein  29.53 
 
 		 751 aa  134  6e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0295  hypothetical protein  30.2 
 
 		 400 aa  132  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.690441  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5981  hypothetical protein  28.54 
 
 		 747 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5107  hypothetical protein  27.57 
 
 		 991 aa  112  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.286492  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0342  hypothetical protein  26.56 
 
 		 742 aa  109  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460096 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4007  hypothetical protein  26.51 
 
 		 976 aa  105  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.109226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0069  hypothetical protein  29.79 
 
 		 969 aa  97.4  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0314244  hitchhiker  0.0000262699 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3629  hypothetical protein  24.22 
 
 		 1276 aa  93.2  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2031  hypothetical protein  31.76 
 
 		 205 aa  89.4  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1027  hypothetical protein  24.37 
 
 		 791 aa  77.8  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3174  hypothetical protein  25.2 
 
 		 1009 aa  73.6  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0612  hypothetical protein  22.25 
 
 		 906 aa  66.6  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2294  hypothetical protein  23.21 
 
 		 411 aa  66.2  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.147546  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2966  hypothetical protein  27.91 
 
 		 1187 aa  60.8  0.00000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1183  hypothetical protein  23.9 
 
 		 811 aa  58.2  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4980  hypothetical protein  22.83 
 
 		 570 aa  57  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0037  hypothetical protein  22.35 
 
 		 926 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2122  TraG family protein  21.94 
 
 		 464 aa  51.2  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0837  DNA transfer in the process of conjugation and F pilus assembly protein  46.51 
 
 		 455 aa  50.8  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00362529  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0073  TraG/TraD family protein  21.75 
 
 		 1166 aa  48.5  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0064  conjugation protein, TraG/TraD family  21.75 
 
 		 1166 aa  48.5  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0093  conjugation protein, TraG/TraD family  21.75 
 
 		 1166 aa  48.5  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3798  TraG family protein  25.14 
 
 		 470 aa  48.5  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0064  TraG/TraD family conjugal transfer protein  27.87 
 
 		 1109 aa  47.8  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0297  hypothetical protein  21.37 
 
 		 1123 aa  47.4  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0652  putative type IV secretory pathway VirD4 components  38.76 
 
 		 602 aa  47  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0250  TraG family protein  32.91 
 
 		 457 aa  47  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2764  hypothetical protein  40.62 
 
 		 752 aa  47  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.656214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0632  hypothetical protein  40.62 
 
 		 708 aa  45.4  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0467  ATPase-like protein  23.76 
 
 		 1034 aa  45.4  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1089  hypothetical protein  22.22 
 
 		 930 aa  45.1  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0247852  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0195  TraG family protein  38.89 
 
 		 457 aa  44.3  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2398  hypothetical protein  36 
 
 		 668 aa  44.3  0.01  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>