65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0632 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_2764  hypothetical protein  48.22 
 
 		 752 aa  652    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.656214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2336  hypothetical protein  55.65 
 
 		 729 aa  766    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000037751  unclonable  0.000000407207 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1751  hypothetical protein  49.51 
 
 		 743 aa  691    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59690  hypothetical protein  54.62 
 
 		 744 aa  773    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000194089  decreased coverage  4.4297400000000005e-19 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4096  putative plasmid transfer protein  56.48 
 
 		 730 aa  775    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0326  putative plasmid transfer protein  56.62 
 
 		 704 aa  764    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0141312 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3414  hypothetical protein  56.09 
 
 		 733 aa  770    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41428  normal  0.0672009 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3937  hypothetical protein  52.02 
 
 		 664 aa  715    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.280709  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0527  hypothetical protein  55.89 
 
 		 730 aa  764    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4179  putative plasmid transfer protein  56.48 
 
 		 704 aa  766    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3718  hypothetical protein  55.6 
 
 		 706 aa  762    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.387295  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1274  hypothetical protein  55.51 
 
 		 730 aa  764    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1408  hypothetical protein  55.51 
 
 		 730 aa  764    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.950579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4501  TraG/TraD family protein  54.48 
 
 		 743 aa  768    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2208  hypothetical protein  56.56 
 
 		 718 aa  775    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.395932  normal  0.45265 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2934  hypothetical protein  55.75 
 
 		 708 aa  769    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2380  hypothetical protein  56.56 
 
 		 718 aa  775    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.248119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1195  hypothetical protein  55.57 
 
 		 728 aa  763    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4169  hypothetical protein  55.36 
 
 		 727 aa  759    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.48663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3305  hypothetical protein  55.46 
 
 		 707 aa  766    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.705232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0963  hypothetical protein  56.56 
 
 		 718 aa  777    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.969966  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3012  hypothetical protein  56.94 
 
 		 701 aa  784    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0632  hypothetical protein  100 
 
 		 708 aa  1458    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2845  hypothetical protein  56.56 
 
 		 721 aa  779    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0673  hypothetical protein  56.41 
 
 		 719 aa  774    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1454  hypothetical protein  54.61 
 
 		 719 aa  756    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.244013 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0448  hypothetical protein  54.36 
 
 		 719 aa  746    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0645  TraG-family protein  56.4 
 
 		 703 aa  772    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1638  hypothetical protein  55.67 
 
 		 719 aa  768    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1055  hypothetical protein  40.92 
 
 		 659 aa  502  1e-141  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1016  hypothetical protein  40.69 
 
 		 644 aa  498  1e-139  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2398  hypothetical protein  39.36 
 
 		 668 aa  491  1e-137  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0881  hypothetical protein  53.85 
 
 		 293 aa  293  7e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0066  type IV conjugative transfer system protein TraD  29.97 
 
 		 621 aa  284  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4266  hypothetical protein  28.92 
 
 		 629 aa  253  6e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2815  type IV conjugative transfer system protein TraD  28.04 
 
 		 615 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2598  hypothetical protein  29.07 
 
 		 635 aa  239  1e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.887082  normal  0.897508 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1175  hypothetical protein  61.2 
 
 		 290 aa  238  3e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5613  hypothetical protein  29.51 
 
 		 622 aa  238  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.920464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4330  hypothetical protein  28.53 
 
 		 637 aa  236  1.0000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.930628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2307  hypothetical protein  29.44 
 
 		 635 aa  236  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.973941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6309  hypothetical protein  30.61 
 
 		 622 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.800389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1549  hypothetical protein  29 
 
 		 633 aa  231  4e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.167533  normal  0.131321 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6502  hypothetical protein  29.15 
 
 		 622 aa  231  5e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.571397  normal  0.732963 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3750  hypothetical protein  28.21 
 
 		 635 aa  229  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.294412 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1518  hypothetical protein  29.35 
 
 		 618 aa  229  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.328078  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5183  hypothetical protein  29.35 
 
 		 618 aa  229  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4741  hypothetical protein  28.76 
 
 		 629 aa  221  5e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.404612 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5224  hypothetical protein  27.69 
 
 		 650 aa  219  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.571099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5471  hypothetical protein  25.48 
 
 		 635 aa  183  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.170815 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4264  hypothetical protein  24.08 
 
 		 624 aa  157  4e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000613459  normal  0.436086 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0250  TraG family protein  25.63 
 
 		 457 aa  100  6e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3798  TraG family protein  25.12 
 
 		 470 aa  99.4  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0837  DNA transfer in the process of conjugation and F pilus assembly protein  23.37 
 
 		 455 aa  99  3e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00362529  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2122  TraG family protein  25.6 
 
 		 464 aa  97.8  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0195  TraG family protein  25.13 
 
 		 457 aa  97.8  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1251  lipoprotein, putative  33.06 
 
 		 619 aa  64.7  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.684077  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0738  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  23.02 
 
 		 557 aa  61.2  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0361  sex pilus assembly and mating pair formation  22.44 
 
 		 589 aa  59.3  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.398823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4965  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  31.97 
 
 		 579 aa  48.5  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5394  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  31.97 
 
 		 579 aa  48.1  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.709491  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0057  hypothetical protein  26.22 
 
 		 952 aa  48.5  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.889998  hitchhiker  0.00629192 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0068  TraG/TraD family conjugal transfer protein  25.93 
 
 		 762 aa  45.8  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6850  type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  40.62 
 
 		 833 aa  45.8  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0108098  normal  1 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0076  trbC protein  25.93 
 
 		 762 aa  45.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>