63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2764 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_2764  hypothetical protein  100 
 
 		 752 aa  1544    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.656214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0632  hypothetical protein  48.22 
 
 		 708 aa  652    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0645  TraG-family protein  45.11 
 
 		 703 aa  595  1e-168  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3718  hypothetical protein  44.82 
 
 		 706 aa  588  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.387295  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4096  putative plasmid transfer protein  45.63 
 
 		 730 aa  581  1e-164  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3937  hypothetical protein  45.04 
 
 		 664 aa  581  1e-164  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.280709  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4179  putative plasmid transfer protein  45.39 
 
 		 704 aa  574  1.0000000000000001e-162  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0326  putative plasmid transfer protein  45.38 
 
 		 704 aa  573  1.0000000000000001e-162  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0141312 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3012  hypothetical protein  43.79 
 
 		 701 aa  570  1e-161  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59690  hypothetical protein  43.42 
 
 		 744 aa  556  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000194089  decreased coverage  4.4297400000000005e-19 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0527  hypothetical protein  43.78 
 
 		 730 aa  556  1e-157  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2934  hypothetical protein  43.68 
 
 		 708 aa  558  1e-157  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3305  hypothetical protein  43.43 
 
 		 707 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.705232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1195  hypothetical protein  43.36 
 
 		 728 aa  555  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3414  hypothetical protein  42.66 
 
 		 733 aa  549  1e-155  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41428  normal  0.0672009 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4501  TraG/TraD family protein  43.29 
 
 		 743 aa  550  1e-155  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2380  hypothetical protein  42.95 
 
 		 718 aa  551  1e-155  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.248119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2336  hypothetical protein  42.82 
 
 		 729 aa  549  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000037751  unclonable  0.000000407207 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0963  hypothetical protein  42.78 
 
 		 718 aa  549  1e-155  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.969966  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2845  hypothetical protein  43.03 
 
 		 721 aa  551  1e-155  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1454  hypothetical protein  44.38 
 
 		 719 aa  551  1e-155  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.244013 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1638  hypothetical protein  43 
 
 		 719 aa  550  1e-155  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2208  hypothetical protein  42.8 
 
 		 718 aa  548  1e-154  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.395932  normal  0.45265 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4169  hypothetical protein  41.44 
 
 		 727 aa  544  1e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.48663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1274  hypothetical protein  42.98 
 
 		 730 aa  544  1e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1408  hypothetical protein  42.98 
 
 		 730 aa  544  1e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.950579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0673  hypothetical protein  42.31 
 
 		 719 aa  542  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0448  hypothetical protein  42.13 
 
 		 719 aa  534  1e-150  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1751  hypothetical protein  40.83 
 
 		 743 aa  518  1.0000000000000001e-145  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1055  hypothetical protein  34.82 
 
 		 659 aa  405  1e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1016  hypothetical protein  35.04 
 
 		 644 aa  402  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2398  hypothetical protein  32.75 
 
 		 668 aa  378  1e-103  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0881  hypothetical protein  48.05 
 
 		 293 aa  237  6e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0066  type IV conjugative transfer system protein TraD  28.87 
 
 		 621 aa  236  8e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4330  hypothetical protein  27.98 
 
 		 637 aa  234  4.0000000000000004e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.930628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2815  type IV conjugative transfer system protein TraD  29.15 
 
 		 615 aa  229  2e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3750  hypothetical protein  28.46 
 
 		 635 aa  227  5.0000000000000005e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.294412 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5183  hypothetical protein  26.89 
 
 		 618 aa  209  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1518  hypothetical protein  26.89 
 
 		 618 aa  209  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.328078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6309  hypothetical protein  27.54 
 
 		 622 aa  208  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.800389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4266  hypothetical protein  26.62 
 
 		 629 aa  206  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5613  hypothetical protein  26.89 
 
 		 622 aa  205  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.920464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1549  hypothetical protein  28.57 
 
 		 633 aa  205  3e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.167533  normal  0.131321 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5471  hypothetical protein  27.17 
 
 		 635 aa  202  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.170815 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6502  hypothetical protein  27.1 
 
 		 622 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.571397  normal  0.732963 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4741  hypothetical protein  27.79 
 
 		 629 aa  198  3e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.404612 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2307  hypothetical protein  27.83 
 
 		 635 aa  196  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.973941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5224  hypothetical protein  27.12 
 
 		 650 aa  193  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.571099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2598  hypothetical protein  26.9 
 
 		 635 aa  190  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.887082  normal  0.897508 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1175  hypothetical protein  43.58 
 
 		 290 aa  170  7e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4264  hypothetical protein  23.8 
 
 		 624 aa  147  6e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000613459  normal  0.436086 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0837  DNA transfer in the process of conjugation and F pilus assembly protein  26.82 
 
 		 455 aa  94.7  5e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00362529  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0195  TraG family protein  23.72 
 
 		 457 aa  92.8  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0250  TraG family protein  23.72 
 
 		 457 aa  92  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2122  TraG family protein  23.09 
 
 		 464 aa  80.9  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3798  TraG family protein  32.32 
 
 		 470 aa  73.9  0.000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1251  lipoprotein, putative  36 
 
 		 619 aa  57  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.684077  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0738  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  23.98 
 
 		 557 aa  53.1  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4079  hypothetical protein  36.63 
 
 		 876 aa  47  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00459285  normal  0.104503 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0361  sex pilus assembly and mating pair formation  22.15 
 
 		 589 aa  47  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.398823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0906  Type IV secretory pathway VirD4 components-like  42.31 
 
 		 765 aa  46.6  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6850  type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  40.62 
 
 		 833 aa  46.6  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0108098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0057  hypothetical protein  37.5 
 
 		 952 aa  44.7  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.889998  hitchhiker  0.00629192 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>