52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_4264 on replicon NC_008573
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008573  Shewana3_4264  hypothetical protein  100 
 
 		 624 aa  1293    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000613459  normal  0.436086 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4266  hypothetical protein  29.79 
 
 		 629 aa  273  8.000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0066  type IV conjugative transfer system protein TraD  31.11 
 
 		 621 aa  259  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6309  hypothetical protein  28.41 
 
 		 622 aa  252  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.800389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6502  hypothetical protein  28.78 
 
 		 622 aa  243  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.571397  normal  0.732963 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5613  hypothetical protein  28.28 
 
 		 622 aa  240  5.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.920464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4330  hypothetical protein  28.88 
 
 		 637 aa  238  3e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.930628  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5183  hypothetical protein  27.87 
 
 		 618 aa  234  3e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1518  hypothetical protein  27.87 
 
 		 618 aa  234  3e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.328078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2815  type IV conjugative transfer system protein TraD  28.73 
 
 		 615 aa  222  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3750  hypothetical protein  28.44 
 
 		 635 aa  221  3e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.294412 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4741  hypothetical protein  29.5 
 
 		 629 aa  219  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.404612 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5471  hypothetical protein  28.03 
 
 		 635 aa  204  5e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.170815 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2598  hypothetical protein  27.2 
 
 		 635 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.887082  normal  0.897508 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2307  hypothetical protein  26.9 
 
 		 635 aa  196  9e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.973941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1549  hypothetical protein  26.11 
 
 		 633 aa  196  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.167533  normal  0.131321 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3718  hypothetical protein  24.7 
 
 		 706 aa  181  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.387295  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5224  hypothetical protein  25.23 
 
 		 650 aa  177  7e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.571099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0645  TraG-family protein  24.32 
 
 		 703 aa  176  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1751  hypothetical protein  25.2 
 
 		 743 aa  176  1.9999999999999998e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4096  putative plasmid transfer protein  25.11 
 
 		 730 aa  172  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3414  hypothetical protein  25.66 
 
 		 733 aa  171  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41428  normal  0.0672009 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4179  putative plasmid transfer protein  25.45 
 
 		 704 aa  171  5e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2336  hypothetical protein  26 
 
 		 729 aa  169  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000037751  unclonable  0.000000407207 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1274  hypothetical protein  25.71 
 
 		 730 aa  169  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1408  hypothetical protein  25.66 
 
 		 730 aa  169  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.950579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1195  hypothetical protein  25.41 
 
 		 728 aa  168  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4169  hypothetical protein  25.71 
 
 		 727 aa  167  5e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.48663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0673  hypothetical protein  26.21 
 
 		 719 aa  167  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1638  hypothetical protein  26.29 
 
 		 719 aa  166  8e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0963  hypothetical protein  24.78 
 
 		 718 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.969966  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0448  hypothetical protein  26.22 
 
 		 719 aa  165  3e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1454  hypothetical protein  24.66 
 
 		 719 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.244013 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0326  putative plasmid transfer protein  25.56 
 
 		 704 aa  164  5.0000000000000005e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0141312 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2208  hypothetical protein  25.89 
 
 		 718 aa  162  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.395932  normal  0.45265 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2380  hypothetical protein  26.42 
 
 		 718 aa  159  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.248119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2845  hypothetical protein  24.45 
 
 		 721 aa  158  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0632  hypothetical protein  24.08 
 
 		 708 aa  157  4e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0527  hypothetical protein  24.59 
 
 		 730 aa  157  5.0000000000000005e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3305  hypothetical protein  24.7 
 
 		 707 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.705232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3012  hypothetical protein  24.18 
 
 		 701 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4501  TraG/TraD family protein  23.38 
 
 		 743 aa  154  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2934  hypothetical protein  24.55 
 
 		 708 aa  153  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59690  hypothetical protein  22.9 
 
 		 744 aa  148  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000194089  decreased coverage  4.4297400000000005e-19 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2764  hypothetical protein  23.8 
 
 		 752 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.656214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3937  hypothetical protein  25.37 
 
 		 664 aa  147  5e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.280709  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1055  hypothetical protein  22.26 
 
 		 659 aa  134  6e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1016  hypothetical protein  22.18 
 
 		 644 aa  129  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2398  hypothetical protein  21.29 
 
 		 668 aa  115  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0837  DNA transfer in the process of conjugation and F pilus assembly protein  23.72 
 
 		 455 aa  77.8  0.0000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00362529  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0881  hypothetical protein  25.93 
 
 		 293 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1175  hypothetical protein  29.68 
 
 		 290 aa  58.9  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>