58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5224 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007949  Bpro_5224  hypothetical protein  100 
 
 		 650 aa  1345    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.571099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4741  hypothetical protein  46.57 
 
 		 629 aa  580  1e-164  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.404612 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5471  hypothetical protein  43.4 
 
 		 635 aa  524  1e-147  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.170815 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4266  hypothetical protein  36.6 
 
 		 629 aa  420  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0066  type IV conjugative transfer system protein TraD  31.06 
 
 		 621 aa  336  5.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2598  hypothetical protein  31.12 
 
 		 635 aa  322  9.999999999999999e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.887082  normal  0.897508 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1549  hypothetical protein  31.34 
 
 		 633 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.167533  normal  0.131321 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2307  hypothetical protein  30.26 
 
 		 635 aa  301  2e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.973941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2815  type IV conjugative transfer system protein TraD  31.34 
 
 		 615 aa  297  4e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6309  hypothetical protein  30.41 
 
 		 622 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.800389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4330  hypothetical protein  28.91 
 
 		 637 aa  266  1e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.930628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1518  hypothetical protein  30.06 
 
 		 618 aa  262  1e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.328078  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5183  hypothetical protein  30.06 
 
 		 618 aa  262  1e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5613  hypothetical protein  29.88 
 
 		 622 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.920464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6502  hypothetical protein  29.54 
 
 		 622 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.571397  normal  0.732963 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4096  putative plasmid transfer protein  29.17 
 
 		 730 aa  248  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3750  hypothetical protein  28.59 
 
 		 635 aa  242  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.294412 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0645  TraG-family protein  29.23 
 
 		 703 aa  241  2e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3718  hypothetical protein  28.25 
 
 		 706 aa  241  4e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.387295  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0326  putative plasmid transfer protein  29.7 
 
 		 704 aa  237  4e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0141312 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1751  hypothetical protein  28.93 
 
 		 743 aa  236  9e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4179  putative plasmid transfer protein  29.4 
 
 		 704 aa  236  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0527  hypothetical protein  27.49 
 
 		 730 aa  228  3e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1454  hypothetical protein  28.03 
 
 		 719 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.244013 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2934  hypothetical protein  27.95 
 
 		 708 aa  223  9e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3305  hypothetical protein  27.66 
 
 		 707 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.705232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0963  hypothetical protein  27.38 
 
 		 718 aa  218  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.969966  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2845  hypothetical protein  28.09 
 
 		 721 aa  218  2e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0632  hypothetical protein  27.69 
 
 		 708 aa  219  2e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1195  hypothetical protein  27.99 
 
 		 728 aa  217  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2208  hypothetical protein  27.31 
 
 		 718 aa  217  7e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.395932  normal  0.45265 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3414  hypothetical protein  27.21 
 
 		 733 aa  216  8e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41428  normal  0.0672009 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2380  hypothetical protein  27.31 
 
 		 718 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.248119  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0673  hypothetical protein  26.8 
 
 		 719 aa  216  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2336  hypothetical protein  27.7 
 
 		 729 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000037751  unclonable  0.000000407207 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0448  hypothetical protein  26.97 
 
 		 719 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4169  hypothetical protein  27.66 
 
 		 727 aa  214  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.48663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3937  hypothetical protein  26.13 
 
 		 664 aa  214  2.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.280709  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1408  hypothetical protein  27.55 
 
 		 730 aa  214  3.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.950579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1274  hypothetical protein  27.55 
 
 		 730 aa  214  3.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3012  hypothetical protein  26.92 
 
 		 701 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1638  hypothetical protein  26.98 
 
 		 719 aa  214  5.999999999999999e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4501  TraG/TraD family protein  26.36 
 
 		 743 aa  210  6e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59690  hypothetical protein  26.58 
 
 		 744 aa  201  5e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000194089  decreased coverage  4.4297400000000005e-19 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2764  hypothetical protein  27.12 
 
 		 752 aa  193  7e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.656214  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1055  hypothetical protein  24.41 
 
 		 659 aa  186  8e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4264  hypothetical protein  25.23 
 
 		 624 aa  177  8e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000613459  normal  0.436086 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1016  hypothetical protein  24.63 
 
 		 644 aa  176  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2398  hypothetical protein  25.68 
 
 		 668 aa  169  1e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0881  hypothetical protein  29.22 
 
 		 293 aa  88.2  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1175  hypothetical protein  28 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0837  DNA transfer in the process of conjugation and F pilus assembly protein  20.89 
 
 		 455 aa  58.2  0.0000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00362529  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0250  TraG family protein  31.33 
 
 		 457 aa  47  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0195  TraG family protein  31.33 
 
 		 457 aa  46.6  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3057  AAA ATPase  52.17 
 
 		 816 aa  45.8  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8472  hypothetical protein  60.53 
 
 		 830 aa  45.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547779  normal  0.957952 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1100  AAA ATPase  47.27 
 
 		 821 aa  43.9  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3905  hypothetical protein  25.44 
 
 		 760 aa  43.9  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>