58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2598 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2307  hypothetical protein  89.92 
 
 		 635 aa  1181    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.973941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2598  hypothetical protein  100 
 
 		 635 aa  1306    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.887082  normal  0.897508 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1549  hypothetical protein  83.55 
 
 		 633 aa  1085    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.167533  normal  0.131321 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0066  type IV conjugative transfer system protein TraD  37.74 
 
 		 621 aa  405  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4266  hypothetical protein  36.23 
 
 		 629 aa  361  2e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2815  type IV conjugative transfer system protein TraD  35.26 
 
 		 615 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4741  hypothetical protein  34.12 
 
 		 629 aa  332  1e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.404612 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5224  hypothetical protein  31.12 
 
 		 650 aa  322  9.999999999999999e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.571099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5183  hypothetical protein  34.63 
 
 		 618 aa  313  4.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1518  hypothetical protein  34.63 
 
 		 618 aa  313  4.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.328078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5613  hypothetical protein  33.49 
 
 		 622 aa  308  3e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.920464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3750  hypothetical protein  31.98 
 
 		 635 aa  298  2e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.294412 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6502  hypothetical protein  33.23 
 
 		 622 aa  295  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.571397  normal  0.732963 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5471  hypothetical protein  33.68 
 
 		 635 aa  285  2.0000000000000002e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.170815 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6309  hypothetical protein  31.52 
 
 		 622 aa  283  8.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.800389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4330  hypothetical protein  31.67 
 
 		 637 aa  273  9e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.930628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0632  hypothetical protein  29.07 
 
 		 708 aa  239  1e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0448  hypothetical protein  28.29 
 
 		 719 aa  239  1e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1638  hypothetical protein  29.66 
 
 		 719 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1751  hypothetical protein  29.6 
 
 		 743 aa  235  2.0000000000000002e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1408  hypothetical protein  29.43 
 
 		 730 aa  233  8.000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.950579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4169  hypothetical protein  29.43 
 
 		 727 aa  231  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.48663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1274  hypothetical protein  29.26 
 
 		 730 aa  231  4e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3414  hypothetical protein  29.17 
 
 		 733 aa  231  4e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41428  normal  0.0672009 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2336  hypothetical protein  29.26 
 
 		 729 aa  231  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000037751  unclonable  0.000000407207 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1195  hypothetical protein  29.9 
 
 		 728 aa  230  6e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4179  putative plasmid transfer protein  29.12 
 
 		 704 aa  228  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0645  TraG-family protein  30.36 
 
 		 703 aa  228  2e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2845  hypothetical protein  29.48 
 
 		 721 aa  228  3e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0326  putative plasmid transfer protein  29.29 
 
 		 704 aa  227  5.0000000000000005e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0141312 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4096  putative plasmid transfer protein  28.97 
 
 		 730 aa  226  8e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3718  hypothetical protein  30.66 
 
 		 706 aa  226  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.387295  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0527  hypothetical protein  28.4 
 
 		 730 aa  226  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0673  hypothetical protein  28.4 
 
 		 719 aa  225  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1454  hypothetical protein  28.01 
 
 		 719 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.244013 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2380  hypothetical protein  28.25 
 
 		 718 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.248119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3937  hypothetical protein  29.31 
 
 		 664 aa  223  9.999999999999999e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.280709  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0963  hypothetical protein  28.74 
 
 		 718 aa  221  3e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.969966  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2208  hypothetical protein  28.28 
 
 		 718 aa  220  7.999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.395932  normal  0.45265 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3012  hypothetical protein  28.68 
 
 		 701 aa  219  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1055  hypothetical protein  27.26 
 
 		 659 aa  214  3.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3305  hypothetical protein  28.35 
 
 		 707 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.705232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2934  hypothetical protein  28.5 
 
 		 708 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1016  hypothetical protein  27.84 
 
 		 644 aa  213  1e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4501  TraG/TraD family protein  27.26 
 
 		 743 aa  204  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59690  hypothetical protein  27.44 
 
 		 744 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000194089  decreased coverage  4.4297400000000005e-19 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4264  hypothetical protein  27.2 
 
 		 624 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000613459  normal  0.436086 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2398  hypothetical protein  27.49 
 
 		 668 aa  195  3e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2764  hypothetical protein  26.9 
 
 		 752 aa  190  7e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.656214  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0881  hypothetical protein  30.57 
 
 		 293 aa  103  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1175  hypothetical protein  30.99 
 
 		 290 aa  81.6  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0195  TraG family protein  21.46 
 
 		 457 aa  73.6  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3798  TraG family protein  21.3 
 
 		 470 aa  73.6  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0250  TraG family protein  21.25 
 
 		 457 aa  72  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2122  TraG family protein  21.97 
 
 		 464 aa  70.5  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0837  DNA transfer in the process of conjugation and F pilus assembly protein  22.54 
 
 		 455 aa  67.4  0.0000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00362529  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1477  type IV conjugative transfer system coupling protein TraD  36.78 
 
 		 609 aa  48.9  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0124  mobilization protein  35.71 
 
 		 635 aa  45.8  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.795434  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>