56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5471 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007950  Bpro_5471  hypothetical protein  100 
 
 		 635 aa  1312    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.170815 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5224  hypothetical protein  43.4 
 
 		 650 aa  559  1e-158  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.571099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4741  hypothetical protein  45.4 
 
 		 629 aa  543  1e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.404612 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4266  hypothetical protein  35.16 
 
 		 629 aa  377  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2307  hypothetical protein  34.28 
 
 		 635 aa  326  6e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.973941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2598  hypothetical protein  33.91 
 
 		 635 aa  323  8e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.887082  normal  0.897508 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1549  hypothetical protein  32.43 
 
 		 633 aa  308  3e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.167533  normal  0.131321 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0066  type IV conjugative transfer system protein TraD  28.93 
 
 		 621 aa  294  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2815  type IV conjugative transfer system protein TraD  32.54 
 
 		 615 aa  292  1e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5613  hypothetical protein  31.85 
 
 		 622 aa  288  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.920464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1518  hypothetical protein  30.88 
 
 		 618 aa  279  9e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.328078  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5183  hypothetical protein  30.88 
 
 		 618 aa  279  9e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6502  hypothetical protein  31.55 
 
 		 622 aa  276  9e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.571397  normal  0.732963 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6309  hypothetical protein  30.15 
 
 		 622 aa  271  4e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.800389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3750  hypothetical protein  29.26 
 
 		 635 aa  265  1e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.294412 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4330  hypothetical protein  28.66 
 
 		 637 aa  258  2e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.930628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4264  hypothetical protein  27.57 
 
 		 624 aa  227  5.0000000000000005e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000613459  normal  0.436086 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1751  hypothetical protein  26.63 
 
 		 743 aa  226  1e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3718  hypothetical protein  28.53 
 
 		 706 aa  225  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.387295  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0645  TraG-family protein  28.44 
 
 		 703 aa  219  8.999999999999998e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2764  hypothetical protein  27.19 
 
 		 752 aa  216  9.999999999999999e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.656214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3937  hypothetical protein  26.16 
 
 		 664 aa  205  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.280709  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4179  putative plasmid transfer protein  27.33 
 
 		 704 aa  205  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1055  hypothetical protein  26.28 
 
 		 659 aa  205  3e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4096  putative plasmid transfer protein  27.35 
 
 		 730 aa  202  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0326  putative plasmid transfer protein  27.63 
 
 		 704 aa  202  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0141312 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1195  hypothetical protein  27.3 
 
 		 728 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0632  hypothetical protein  26.14 
 
 		 708 aa  201  3e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3414  hypothetical protein  26.99 
 
 		 733 aa  201  3.9999999999999996e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41428  normal  0.0672009 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1016  hypothetical protein  26.13 
 
 		 644 aa  201  3.9999999999999996e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1454  hypothetical protein  26.76 
 
 		 719 aa  200  5e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.244013 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4169  hypothetical protein  26.69 
 
 		 727 aa  199  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.48663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1408  hypothetical protein  26.99 
 
 		 730 aa  197  4.0000000000000005e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.950579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1274  hypothetical protein  26.99 
 
 		 730 aa  197  5.000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2336  hypothetical protein  26.99 
 
 		 729 aa  196  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000037751  unclonable  0.000000407207 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0527  hypothetical protein  26.07 
 
 		 730 aa  194  3e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0673  hypothetical protein  25.57 
 
 		 719 aa  193  7e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2845  hypothetical protein  26.3 
 
 		 721 aa  193  8e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0963  hypothetical protein  26.48 
 
 		 718 aa  192  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.969966  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1638  hypothetical protein  25.99 
 
 		 719 aa  192  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2380  hypothetical protein  26.11 
 
 		 718 aa  191  5e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.248119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2208  hypothetical protein  26.24 
 
 		 718 aa  190  5.999999999999999e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.395932  normal  0.45265 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0448  hypothetical protein  26.07 
 
 		 719 aa  189  1e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4501  TraG/TraD family protein  24.46 
 
 		 743 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2398  hypothetical protein  25 
 
 		 668 aa  182  1e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2934  hypothetical protein  26.18 
 
 		 708 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59690  hypothetical protein  24.71 
 
 		 744 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000194089  decreased coverage  4.4297400000000005e-19 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3305  hypothetical protein  26.18 
 
 		 707 aa  180  8e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.705232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3012  hypothetical protein  25.11 
 
 		 701 aa  179  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0837  DNA transfer in the process of conjugation and F pilus assembly protein  24.43 
 
 		 455 aa  96.7  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00362529  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0881  hypothetical protein  28.25 
 
 		 293 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1175  hypothetical protein  25.62 
 
 		 290 aa  56.6  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1111  type IV secretion system protein VirD4  27.27 
 
 		 509 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0738  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  23.6 
 
 		 557 aa  48.9  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2122  TraG family protein  20.99 
 
 		 464 aa  48.9  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0361  sex pilus assembly and mating pair formation  20 
 
 		 589 aa  45.1  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.398823  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>