59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4179 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4179  putative plasmid transfer protein  100 
 
 		 704 aa  1446    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0963  hypothetical protein  63.29 
 
 		 718 aa  885    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.969966  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3937  hypothetical protein  55.21 
 
 		 664 aa  754    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.280709  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0527  hypothetical protein  61.91 
 
 		 730 aa  888    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3305  hypothetical protein  62.54 
 
 		 707 aa  858    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.705232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1274  hypothetical protein  63.13 
 
 		 730 aa  883    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1408  hypothetical protein  63.13 
 
 		 730 aa  885    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.950579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4169  hypothetical protein  62.54 
 
 		 727 aa  885    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.48663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2208  hypothetical protein  63.87 
 
 		 718 aa  884    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.395932  normal  0.45265 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2845  hypothetical protein  63.26 
 
 		 721 aa  880    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2380  hypothetical protein  63.29 
 
 		 718 aa  873    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.248119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4096  putative plasmid transfer protein  95.6 
 
 		 730 aa  1387    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0326  putative plasmid transfer protein  97.59 
 
 		 704 aa  1395    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0141312 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2934  hypothetical protein  63.11 
 
 		 708 aa  865    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4501  TraG/TraD family protein  58.86 
 
 		 743 aa  836    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3414  hypothetical protein  62.68 
 
 		 733 aa  881    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41428  normal  0.0672009 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3718  hypothetical protein  68.7 
 
 		 706 aa  1025    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.387295  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59690  hypothetical protein  58.59 
 
 		 744 aa  831    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000194089  decreased coverage  4.4297400000000005e-19 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1751  hypothetical protein  56.36 
 
 		 743 aa  774    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2336  hypothetical protein  62.82 
 
 		 729 aa  891    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000037751  unclonable  0.000000407207 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1195  hypothetical protein  61.67 
 
 		 728 aa  883    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641655  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0673  hypothetical protein  63.11 
 
 		 719 aa  877    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0448  hypothetical protein  62.34 
 
 		 719 aa  868    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3012  hypothetical protein  64.06 
 
 		 701 aa  884    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0632  hypothetical protein  56.48 
 
 		 708 aa  773    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0645  TraG-family protein  71.8 
 
 		 703 aa  1052    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1638  hypothetical protein  63.2 
 
 		 719 aa  886    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1454  hypothetical protein  60.89 
 
 		 719 aa  848    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.244013 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2764  hypothetical protein  45.39 
 
 		 752 aa  581  1e-164  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.656214  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1055  hypothetical protein  39.5 
 
 		 659 aa  484  1e-135  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1016  hypothetical protein  38.68 
 
 		 644 aa  471  1.0000000000000001e-131  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2398  hypothetical protein  37.6 
 
 		 668 aa  463  1e-129  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0881  hypothetical protein  64.06 
 
 		 293 aa  330  4e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5183  hypothetical protein  31.87 
 
 		 618 aa  269  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1518  hypothetical protein  31.87 
 
 		 618 aa  269  1e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.328078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1175  hypothetical protein  62.07 
 
 		 290 aa  265  2e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2815  type IV conjugative transfer system protein TraD  28.77 
 
 		 615 aa  261  3e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0066  type IV conjugative transfer system protein TraD  28.03 
 
 		 621 aa  261  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4330  hypothetical protein  30.47 
 
 		 637 aa  255  2.0000000000000002e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.930628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4266  hypothetical protein  30.18 
 
 		 629 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5224  hypothetical protein  29.57 
 
 		 650 aa  246  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.571099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6502  hypothetical protein  30.18 
 
 		 622 aa  244  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.571397  normal  0.732963 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1549  hypothetical protein  28.98 
 
 		 633 aa  236  8e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.167533  normal  0.131321 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5613  hypothetical protein  29.65 
 
 		 622 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.920464  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4741  hypothetical protein  30.11 
 
 		 629 aa  235  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.404612 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2307  hypothetical protein  29.91 
 
 		 635 aa  233  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.973941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2598  hypothetical protein  29.12 
 
 		 635 aa  229  1e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.887082  normal  0.897508 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3750  hypothetical protein  29.65 
 
 		 635 aa  228  3e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.294412 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6309  hypothetical protein  29.9 
 
 		 622 aa  226  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.800389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5471  hypothetical protein  27.33 
 
 		 635 aa  195  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.170815 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4264  hypothetical protein  25.75 
 
 		 624 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000613459  normal  0.436086 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2122  TraG family protein  24.39 
 
 		 464 aa  100  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0250  TraG family protein  24.58 
 
 		 457 aa  91.7  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0195  TraG family protein  23.58 
 
 		 457 aa  90.1  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3798  TraG family protein  23.48 
 
 		 470 aa  87  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0837  DNA transfer in the process of conjugation and F pilus assembly protein  23.47 
 
 		 455 aa  79.3  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00362529  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0361  sex pilus assembly and mating pair formation  21.46 
 
 		 589 aa  59.7  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.398823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0738  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  22.67 
 
 		 557 aa  58.9  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1251  lipoprotein, putative  33.07 
 
 		 619 aa  58.5  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.684077  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>