61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6502 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010087  Bmul_5613  hypothetical protein  86.17 
 
 		 622 aa  1134    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.920464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6502  hypothetical protein  100 
 
 		 622 aa  1286    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.571397  normal  0.732963 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1518  hypothetical protein  71.5 
 
 		 618 aa  911    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.328078  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5183  hypothetical protein  71.5 
 
 		 618 aa  911    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6309  hypothetical protein  70.51 
 
 		 622 aa  905    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.800389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4330  hypothetical protein  37.09 
 
 		 637 aa  426  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.930628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3750  hypothetical protein  36.38 
 
 		 635 aa  383  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.294412 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4266  hypothetical protein  35.21 
 
 		 629 aa  347  5e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0066  type IV conjugative transfer system protein TraD  32.8 
 
 		 621 aa  335  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1549  hypothetical protein  32.28 
 
 		 633 aa  306  6e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.167533  normal  0.131321 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2598  hypothetical protein  33.23 
 
 		 635 aa  304  4.0000000000000003e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.887082  normal  0.897508 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2815  type IV conjugative transfer system protein TraD  32.14 
 
 		 615 aa  303  6.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2307  hypothetical protein  32.23 
 
 		 635 aa  301  2e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.973941  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4741  hypothetical protein  34.16 
 
 		 629 aa  298  3e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.404612 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5224  hypothetical protein  30.24 
 
 		 650 aa  267  5e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.571099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0645  TraG-family protein  30.96 
 
 		 703 aa  261  3e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1751  hypothetical protein  30.28 
 
 		 743 aa  260  6e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3012  hypothetical protein  31.3 
 
 		 701 aa  258  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3718  hypothetical protein  30.97 
 
 		 706 aa  256  7e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.387295  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1454  hypothetical protein  30.79 
 
 		 719 aa  256  9e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.244013 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5471  hypothetical protein  31.35 
 
 		 635 aa  251  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.170815 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4096  putative plasmid transfer protein  30.02 
 
 		 730 aa  251  3e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4264  hypothetical protein  28.78 
 
 		 624 aa  250  5e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000613459  normal  0.436086 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2208  hypothetical protein  30.68 
 
 		 718 aa  249  7e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.395932  normal  0.45265 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0448  hypothetical protein  29.9 
 
 		 719 aa  246  9.999999999999999e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1638  hypothetical protein  30.98 
 
 		 719 aa  245  9.999999999999999e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2845  hypothetical protein  30.53 
 
 		 721 aa  246  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0673  hypothetical protein  30.34 
 
 		 719 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0963  hypothetical protein  30.73 
 
 		 718 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.969966  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4179  putative plasmid transfer protein  30.41 
 
 		 704 aa  245  1.9999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0326  putative plasmid transfer protein  30.24 
 
 		 704 aa  245  1.9999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0141312 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2380  hypothetical protein  30.62 
 
 		 718 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.248119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4501  TraG/TraD family protein  28.26 
 
 		 743 aa  240  5e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3305  hypothetical protein  30.52 
 
 		 707 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.705232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2934  hypothetical protein  30.52 
 
 		 708 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0632  hypothetical protein  29.15 
 
 		 708 aa  238  3e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59690  hypothetical protein  28.21 
 
 		 744 aa  237  4e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000194089  decreased coverage  4.4297400000000005e-19 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0527  hypothetical protein  30.06 
 
 		 730 aa  236  8e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4169  hypothetical protein  29.26 
 
 		 727 aa  234  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.48663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3414  hypothetical protein  29.86 
 
 		 733 aa  232  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41428  normal  0.0672009 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3937  hypothetical protein  30.18 
 
 		 664 aa  231  3e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.280709  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1274  hypothetical protein  28.46 
 
 		 730 aa  230  7e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1408  hypothetical protein  28.46 
 
 		 730 aa  229  9e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.950579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2336  hypothetical protein  29.25 
 
 		 729 aa  229  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000037751  unclonable  0.000000407207 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1195  hypothetical protein  28.97 
 
 		 728 aa  228  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2764  hypothetical protein  26.92 
 
 		 752 aa  206  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.656214  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1055  hypothetical protein  25.82 
 
 		 659 aa  165  3e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1016  hypothetical protein  25.62 
 
 		 644 aa  163  7e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2398  hypothetical protein  26 
 
 		 668 aa  163  7e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0881  hypothetical protein  34.25 
 
 		 293 aa  124  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1175  hypothetical protein  32.64 
 
 		 290 aa  89.4  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0738  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  23.41 
 
 		 557 aa  69.7  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0837  DNA transfer in the process of conjugation and F pilus assembly protein  23.42 
 
 		 455 aa  65.5  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00362529  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0250  TraG family protein  21.3 
 
 		 457 aa  62.8  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0195  TraG family protein  20.8 
 
 		 457 aa  58.5  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2122  TraG family protein  20.75 
 
 		 464 aa  55.1  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0361  sex pilus assembly and mating pair formation  23.53 
 
 		 589 aa  52.4  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.398823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1567  putative type IV secretory pathway VirD4 component  28.26 
 
 		 571 aa  48.9  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6487  hypothetical protein  95.65 
 
 		 123 aa  48.9  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3798  TraG family protein  21.41 
 
 		 470 aa  46.6  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5397  hypothetical protein  30.51 
 
 		 562 aa  44.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>