68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0361 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0361  sex pilus assembly and mating pair formation  100 
 
 		 589 aa  1211    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.398823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1251  lipoprotein, putative  41.21 
 
 		 619 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.684077  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3242  hypothetical protein  29.25 
 
 		 612 aa  121  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1055  hypothetical protein  24.26 
 
 		 659 aa  105  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1816  IcmO protein  23.09 
 
 		 792 aa  104  4e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0366  IcmO  23.09 
 
 		 792 aa  104  5e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0738  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  25.33 
 
 		 557 aa  99.8  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0512  hypothetical protein  23.9 
 
 		 783 aa  98.2  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0488  hypothetical protein  23.9 
 
 		 783 aa  98.6  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2398  hypothetical protein  22.76 
 
 		 668 aa  95.5  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1016  hypothetical protein  22.98 
 
 		 644 aa  95.9  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0057  hypothetical protein  23.29 
 
 		 952 aa  94.7  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.889998  hitchhiker  0.00629192 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2122  TraG family protein  25.4 
 
 		 464 aa  89.7  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0527  hypothetical protein  23.48 
 
 		 730 aa  81.6  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1751  hypothetical protein  23.05 
 
 		 743 aa  81.3  0.00000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0066  type IV conjugative transfer system protein TraD  23.72 
 
 		 621 aa  80.1  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0963  hypothetical protein  22.02 
 
 		 718 aa  77.8  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.969966  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0195  TraG family protein  22.4 
 
 		 457 aa  77.8  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0122  putative type IV secretion system protein IcmO/DotL  23.76 
 
 		 934 aa  77  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2380  hypothetical protein  22.12 
 
 		 718 aa  77  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.248119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0250  TraG family protein  22.4 
 
 		 457 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2208  hypothetical protein  22.12 
 
 		 718 aa  76.6  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.395932  normal  0.45265 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4169  hypothetical protein  22.36 
 
 		 727 aa  75.5  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.48663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3750  hypothetical protein  23.17 
 
 		 635 aa  74.3  0.000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.294412 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0068  TraG/TraD family conjugal transfer protein  23.36 
 
 		 762 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3414  hypothetical protein  22.6 
 
 		 733 aa  73.2  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41428  normal  0.0672009 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0448  hypothetical protein  22.18 
 
 		 719 aa  73.2  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0076  trbC protein  23.36 
 
 		 762 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1274  hypothetical protein  22.59 
 
 		 730 aa  72.4  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1195  hypothetical protein  22.29 
 
 		 728 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2336  hypothetical protein  22.44 
 
 		 729 aa  72  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000037751  unclonable  0.000000407207 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0673  hypothetical protein  21.9 
 
 		 719 aa  72  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0837  DNA transfer in the process of conjugation and F pilus assembly protein  22.37 
 
 		 455 aa  72  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00362529  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0645  TraG-family protein  23.81 
 
 		 703 aa  71.6  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0632  hypothetical protein  23.45 
 
 		 708 aa  69.7  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1638  hypothetical protein  21.63 
 
 		 719 aa  68.9  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1408  hypothetical protein  22.47 
 
 		 730 aa  69.7  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.950579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3718  hypothetical protein  23.82 
 
 		 706 aa  66.6  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.387295  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1454  hypothetical protein  20.57 
 
 		 719 aa  67  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.244013 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0314  hypothetical protein  23.73 
 
 		 425 aa  67  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4330  hypothetical protein  23.53 
 
 		 637 aa  67  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.930628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0075  TrbC  23.26 
 
 		 763 aa  63.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0356259 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0326  putative plasmid transfer protein  22.48 
 
 		 704 aa  62  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0141312 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3305  hypothetical protein  21.14 
 
 		 707 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.705232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4501  TraG/TraD family protein  21.15 
 
 		 743 aa  61.2  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4179  putative plasmid transfer protein  22.06 
 
 		 704 aa  59.7  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2934  hypothetical protein  20.93 
 
 		 708 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5613  hypothetical protein  21.81 
 
 		 622 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.920464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4096  putative plasmid transfer protein  21.7 
 
 		 730 aa  58.5  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3012  hypothetical protein  20.48 
 
 		 701 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2845  hypothetical protein  20.38 
 
 		 721 aa  57  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59690  hypothetical protein  21.51 
 
 		 744 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000194089  decreased coverage  4.4297400000000005e-19 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3686  DotL  27.17 
 
 		 786 aa  53.9  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00900266  normal  0.235831 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6309  hypothetical protein  22.57 
 
 		 622 aa  52.8  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.800389  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5183  hypothetical protein  22.57 
 
 		 618 aa  51.6  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6502  hypothetical protein  23.53 
 
 		 622 aa  51.6  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.571397  normal  0.732963 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1518  hypothetical protein  22.57 
 
 		 618 aa  51.6  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.328078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3798  TraG family protein  21.47 
 
 		 470 aa  50.8  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2764  hypothetical protein  19.92 
 
 		 752 aa  48.9  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.656214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2815  type IV conjugative transfer system protein TraD  26.12 
 
 		 615 aa  45.8  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3629  hypothetical protein  21.05 
 
 		 1276 aa  46.2  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03523  TrbC-like protein  24.68 
 
 		 387 aa  45.8  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.236251  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4265  hypothetical protein  22.61 
 
 		 950 aa  45.8  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3017  hypothetical protein  33.67 
 
 		 828 aa  45.1  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4266  hypothetical protein  22.22 
 
 		 629 aa  45.1  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0057  hypothetical protein  27.41 
 
 		 590 aa  44.3  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0209487  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0044  hypothetical protein  21.59 
 
 		 608 aa  44.3  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.612223  normal  0.249044 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2793  TRAG protein  21.68 
 
 		 661 aa  44.3  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0977234  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>