57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1549 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1549  hypothetical protein  100 
 
 		 633 aa  1298    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.167533  normal  0.131321 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2307  hypothetical protein  83.87 
 
 		 635 aa  1088    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.973941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2598  hypothetical protein  83.55 
 
 		 635 aa  1085    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.887082  normal  0.897508 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0066  type IV conjugative transfer system protein TraD  39.59 
 
 		 621 aa  419  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4266  hypothetical protein  35.92 
 
 		 629 aa  373  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2815  type IV conjugative transfer system protein TraD  36.38 
 
 		 615 aa  355  1e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4741  hypothetical protein  34.49 
 
 		 629 aa  329  1.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.404612 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5183  hypothetical protein  33.33 
 
 		 618 aa  306  6e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1518  hypothetical protein  33.33 
 
 		 618 aa  306  6e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.328078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5224  hypothetical protein  31.34 
 
 		 650 aa  305  1.0000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.571099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6502  hypothetical protein  32.28 
 
 		 622 aa  299  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.571397  normal  0.732963 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5613  hypothetical protein  31.46 
 
 		 622 aa  291  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.920464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3750  hypothetical protein  31.08 
 
 		 635 aa  285  1.0000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.294412 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6309  hypothetical protein  31 
 
 		 622 aa  280  4e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.800389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5471  hypothetical protein  32.99 
 
 		 635 aa  277  3e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.170815 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4330  hypothetical protein  30.71 
 
 		 637 aa  266  8.999999999999999e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.930628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0645  TraG-family protein  30.46 
 
 		 703 aa  246  9e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4096  putative plasmid transfer protein  28.59 
 
 		 730 aa  238  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3718  hypothetical protein  29.71 
 
 		 706 aa  238  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.387295  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0326  putative plasmid transfer protein  28.96 
 
 		 704 aa  234  3e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0141312 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4179  putative plasmid transfer protein  28.75 
 
 		 704 aa  234  4.0000000000000004e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0632  hypothetical protein  29 
 
 		 708 aa  231  4e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3937  hypothetical protein  28.4 
 
 		 664 aa  229  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.280709  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1638  hypothetical protein  27.8 
 
 		 719 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0673  hypothetical protein  28.51 
 
 		 719 aa  226  7e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2845  hypothetical protein  28.08 
 
 		 721 aa  226  8e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0963  hypothetical protein  28.72 
 
 		 718 aa  225  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.969966  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2380  hypothetical protein  28.51 
 
 		 718 aa  225  2e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.248119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2208  hypothetical protein  28.72 
 
 		 718 aa  225  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.395932  normal  0.45265 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1751  hypothetical protein  28.27 
 
 		 743 aa  224  4.9999999999999996e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4169  hypothetical protein  27.58 
 
 		 727 aa  223  7e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.48663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0527  hypothetical protein  28.61 
 
 		 730 aa  223  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1408  hypothetical protein  27.38 
 
 		 730 aa  222  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.950579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2336  hypothetical protein  27.34 
 
 		 729 aa  222  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000037751  unclonable  0.000000407207 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1454  hypothetical protein  26.98 
 
 		 719 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.244013 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0448  hypothetical protein  27.43 
 
 		 719 aa  222  1.9999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3414  hypothetical protein  27.64 
 
 		 733 aa  221  3e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41428  normal  0.0672009 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1195  hypothetical protein  27.34 
 
 		 728 aa  221  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1274  hypothetical protein  27.19 
 
 		 730 aa  220  6e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1055  hypothetical protein  28.61 
 
 		 659 aa  219  8.999999999999998e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3012  hypothetical protein  28.64 
 
 		 701 aa  216  7e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1016  hypothetical protein  28.22 
 
 		 644 aa  215  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3305  hypothetical protein  28.71 
 
 		 707 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.705232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2934  hypothetical protein  28.87 
 
 		 708 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2764  hypothetical protein  28.57 
 
 		 752 aa  205  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.656214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4501  TraG/TraD family protein  25.92 
 
 		 743 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4264  hypothetical protein  26.11 
 
 		 624 aa  196  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000613459  normal  0.436086 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59690  hypothetical protein  26.36 
 
 		 744 aa  194  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000194089  decreased coverage  4.4297400000000005e-19 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2398  hypothetical protein  26.92 
 
 		 668 aa  190  9e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0881  hypothetical protein  31.11 
 
 		 293 aa  107  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1175  hypothetical protein  30.13 
 
 		 290 aa  79.3  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3798  TraG family protein  22.34 
 
 		 470 aa  72  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0195  TraG family protein  21.38 
 
 		 457 aa  69.7  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0250  TraG family protein  21.38 
 
 		 457 aa  68.6  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0837  DNA transfer in the process of conjugation and F pilus assembly protein  23.63 
 
 		 455 aa  67.4  0.0000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00362529  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2122  TraG family protein  25.41 
 
 		 464 aa  54.3  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1477  type IV conjugative transfer system coupling protein TraD  46.81 
 
 		 609 aa  44.7  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>