66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2815 on replicon NC_013930
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013930  TK90_2815  type IV conjugative transfer system protein TraD  100 
 
 		 615 aa  1264    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0066  type IV conjugative transfer system protein TraD  40.94 
 
 		 621 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4266  hypothetical protein  37.26 
 
 		 629 aa  375  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1549  hypothetical protein  36.38 
 
 		 633 aa  363  5.0000000000000005e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.167533  normal  0.131321 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2307  hypothetical protein  35.79 
 
 		 635 aa  353  5.9999999999999994e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.973941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2598  hypothetical protein  35.26 
 
 		 635 aa  350  5e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.887082  normal  0.897508 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4330  hypothetical protein  34.55 
 
 		 637 aa  330  7e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.930628  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4741  hypothetical protein  33.85 
 
 		 629 aa  326  6e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.404612 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1518  hypothetical protein  31.88 
 
 		 618 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.328078  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5183  hypothetical protein  31.88 
 
 		 618 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6309  hypothetical protein  33.02 
 
 		 622 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.800389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3750  hypothetical protein  31.9 
 
 		 635 aa  313  6.999999999999999e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.294412 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5613  hypothetical protein  32.25 
 
 		 622 aa  310  4e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.920464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5224  hypothetical protein  31.34 
 
 		 650 aa  310  5.9999999999999995e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.571099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6502  hypothetical protein  32.14 
 
 		 622 aa  309  9e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.571397  normal  0.732963 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5471  hypothetical protein  33.7 
 
 		 635 aa  277  5e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.170815 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0645  TraG-family protein  31.8 
 
 		 703 aa  276  7e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3718  hypothetical protein  32.03 
 
 		 706 aa  273  7e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.387295  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3937  hypothetical protein  31.22 
 
 		 664 aa  272  1e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.280709  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1454  hypothetical protein  29.7 
 
 		 719 aa  270  7e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.244013 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0673  hypothetical protein  30.05 
 
 		 719 aa  266  8e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4169  hypothetical protein  29.82 
 
 		 727 aa  265  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.48663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0527  hypothetical protein  29.8 
 
 		 730 aa  265  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1751  hypothetical protein  30.14 
 
 		 743 aa  263  4.999999999999999e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2336  hypothetical protein  29.66 
 
 		 729 aa  263  4.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000037751  unclonable  0.000000407207 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3414  hypothetical protein  30.1 
 
 		 733 aa  262  1e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41428  normal  0.0672009 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1195  hypothetical protein  29.96 
 
 		 728 aa  262  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2208  hypothetical protein  29.48 
 
 		 718 aa  263  1e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.395932  normal  0.45265 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1638  hypothetical protein  29.31 
 
 		 719 aa  261  2e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4179  putative plasmid transfer protein  28.77 
 
 		 704 aa  261  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2845  hypothetical protein  28.92 
 
 		 721 aa  261  3e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1408  hypothetical protein  29.66 
 
 		 730 aa  261  3e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.950579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1274  hypothetical protein  29.66 
 
 		 730 aa  261  3e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0963  hypothetical protein  29.59 
 
 		 718 aa  261  3e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.969966  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4096  putative plasmid transfer protein  28.81 
 
 		 730 aa  260  4e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0326  putative plasmid transfer protein  29.22 
 
 		 704 aa  259  8e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0141312 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2380  hypothetical protein  28.98 
 
 		 718 aa  257  4e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.248119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2934  hypothetical protein  29.22 
 
 		 708 aa  257  4e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3012  hypothetical protein  28.22 
 
 		 701 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3305  hypothetical protein  28.76 
 
 		 707 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.705232  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0448  hypothetical protein  29.64 
 
 		 719 aa  254  3e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0632  hypothetical protein  28.44 
 
 		 708 aa  244  5e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4501  TraG/TraD family protein  28.12 
 
 		 743 aa  242  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59690  hypothetical protein  27.51 
 
 		 744 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000194089  decreased coverage  4.4297400000000005e-19 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2764  hypothetical protein  29.15 
 
 		 752 aa  233  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.656214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4264  hypothetical protein  28.62 
 
 		 624 aa  232  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000613459  normal  0.436086 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1055  hypothetical protein  29.64 
 
 		 659 aa  226  1e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1016  hypothetical protein  29.23 
 
 		 644 aa  224  3e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2398  hypothetical protein  27.63 
 
 		 668 aa  214  4.9999999999999996e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0881  hypothetical protein  35.02 
 
 		 293 aa  140  6e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0837  DNA transfer in the process of conjugation and F pilus assembly protein  24.23 
 
 		 455 aa  100  8e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00362529  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1175  hypothetical protein  32.03 
 
 		 290 aa  84.3  0.000000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3798  TraG family protein  22.43 
 
 		 470 aa  77  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0738  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  23.81 
 
 		 557 aa  75.9  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2122  TraG family protein  21.23 
 
 		 464 aa  66.2  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0250  TraG family protein  24.81 
 
 		 457 aa  54.3  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0195  TraG family protein  24.81 
 
 		 457 aa  54.3  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1026  hypothetical protein  24.36 
 
 		 657 aa  49.7  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.272564 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0983  hypothetical protein  48.21 
 
 		 762 aa  47.4  0.0007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.137038  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1696  hypothetical protein  48.21 
 
 		 764 aa  46.6  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000294033  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0124  mobilization protein  44.64 
 
 		 635 aa  46.2  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.795434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0361  sex pilus assembly and mating pair formation  26.12 
 
 		 589 aa  45.8  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.398823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1505  hypothetical protein  48.33 
 
 		 753 aa  45.8  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4258  superfamily I DNA/RNA helicase  28.57 
 
 		 1108 aa  45.1  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0239  hypothetical protein  36.14 
 
 		 734 aa  43.9  0.009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.72436  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1689  conjugation protein  39.74 
 
 		 1342 aa  43.5  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>