17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_B0124 on replicon NC_011092
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011092  SeSA_B0124  mobilization protein  100 
 
 		 635 aa  1303    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.795434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1477  type IV conjugative transfer system coupling protein TraD  54.7 
 
 		 609 aa  630  1e-179  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5394  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  25.28 
 
 		 579 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.709491  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4965  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  25.06 
 
 		 579 aa  117  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6729  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  24.66 
 
 		 830 aa  53.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.577691  normal  0.546954 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3242  hypothetical protein  24.74 
 
 		 612 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0066  type IV conjugative transfer system protein TraD  41.27 
 
 		 621 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1055  hypothetical protein  35.62 
 
 		 659 aa  47.4  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2815  type IV conjugative transfer system protein TraD  44.64 
 
 		 615 aa  45.8  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2068  hypothetical protein  22.74 
 
 		 728 aa  46.2  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000291289  normal  0.0152831 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4079  hypothetical protein  21.93 
 
 		 876 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00459285  normal  0.104503 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1694  Type IV secretory pathway VirD4 components-like  23.64 
 
 		 832 aa  46.2  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000925009  normal  0.0597569 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2307  hypothetical protein  33.33 
 
 		 635 aa  45.8  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.973941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2598  hypothetical protein  35.71 
 
 		 635 aa  45.4  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.887082  normal  0.897508 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2508  hypothetical protein  32.41 
 
 		 792 aa  45.8  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0860063 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1016  hypothetical protein  34.25 
 
 		 644 aa  45.1  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6850  type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  40.98 
 
 		 833 aa  43.9  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0108098  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>