61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4330 on replicon NC_008757
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3750  hypothetical protein  62.52 
 
 		 635 aa  801    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.294412 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4330  hypothetical protein  100 
 
 		 637 aa  1314    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.930628  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5183  hypothetical protein  39.38 
 
 		 618 aa  430  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1518  hypothetical protein  39.38 
 
 		 618 aa  430  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.328078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5613  hypothetical protein  37.72 
 
 		 622 aa  426  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.920464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6309  hypothetical protein  38.72 
 
 		 622 aa  427  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.800389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6502  hypothetical protein  37.09 
 
 		 622 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.571397  normal  0.732963 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0066  type IV conjugative transfer system protein TraD  33.49 
 
 		 621 aa  338  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2815  type IV conjugative transfer system protein TraD  34.29 
 
 		 615 aa  325  2e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4266  hypothetical protein  32.52 
 
 		 629 aa  302  1e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1454  hypothetical protein  31.11 
 
 		 719 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.244013 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4741  hypothetical protein  30.38 
 
 		 629 aa  276  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.404612 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0527  hypothetical protein  31.84 
 
 		 730 aa  273  7e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2598  hypothetical protein  31.67 
 
 		 635 aa  273  9e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.887082  normal  0.897508 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2208  hypothetical protein  31.55 
 
 		 718 aa  271  2e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.395932  normal  0.45265 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2307  hypothetical protein  31.45 
 
 		 635 aa  271  4e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.973941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1751  hypothetical protein  32.78 
 
 		 743 aa  269  1e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2845  hypothetical protein  31.43 
 
 		 721 aa  269  1e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3012  hypothetical protein  31.17 
 
 		 701 aa  267  4e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0963  hypothetical protein  31.1 
 
 		 718 aa  267  4e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.969966  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1549  hypothetical protein  30.71 
 
 		 633 aa  266  8.999999999999999e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.167533  normal  0.131321 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5224  hypothetical protein  28.91 
 
 		 650 aa  266  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.571099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0673  hypothetical protein  30.91 
 
 		 719 aa  265  1e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2380  hypothetical protein  31.1 
 
 		 718 aa  265  1e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.248119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4169  hypothetical protein  30.67 
 
 		 727 aa  265  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.48663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1638  hypothetical protein  30.83 
 
 		 719 aa  265  3e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0448  hypothetical protein  30.01 
 
 		 719 aa  263  8e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3414  hypothetical protein  31.22 
 
 		 733 aa  263  1e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41428  normal  0.0672009 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0645  TraG-family protein  30.23 
 
 		 703 aa  263  1e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1408  hypothetical protein  30.98 
 
 		 730 aa  261  2e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.950579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3305  hypothetical protein  31.63 
 
 		 707 aa  262  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.705232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1195  hypothetical protein  30.49 
 
 		 728 aa  261  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1274  hypothetical protein  30.98 
 
 		 730 aa  261  3e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2336  hypothetical protein  29.88 
 
 		 729 aa  260  6e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000037751  unclonable  0.000000407207 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2934  hypothetical protein  31.58 
 
 		 708 aa  260  6e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4501  TraG/TraD family protein  30.1 
 
 		 743 aa  259  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4096  putative plasmid transfer protein  32.09 
 
 		 730 aa  259  1e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3718  hypothetical protein  29.6 
 
 		 706 aa  258  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.387295  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59690  hypothetical protein  29.89 
 
 		 744 aa  258  3e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000194089  decreased coverage  4.4297400000000005e-19 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0326  putative plasmid transfer protein  32.23 
 
 		 704 aa  255  2.0000000000000002e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0141312 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4179  putative plasmid transfer protein  31.48 
 
 		 704 aa  253  9.000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3937  hypothetical protein  29.61 
 
 		 664 aa  253  1e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.280709  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4264  hypothetical protein  28.88 
 
 		 624 aa  238  3e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000613459  normal  0.436086 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0632  hypothetical protein  28.53 
 
 		 708 aa  236  1.0000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5471  hypothetical protein  28.43 
 
 		 635 aa  235  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.170815 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2764  hypothetical protein  27.98 
 
 		 752 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.656214  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1016  hypothetical protein  29.6 
 
 		 644 aa  228  3e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1055  hypothetical protein  29.04 
 
 		 659 aa  228  3e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2398  hypothetical protein  28.02 
 
 		 668 aa  221  3e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0881  hypothetical protein  32.27 
 
 		 293 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0837  DNA transfer in the process of conjugation and F pilus assembly protein  23.68 
 
 		 455 aa  82.4  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00362529  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0738  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  24.87 
 
 		 557 aa  81.3  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3798  TraG family protein  25.06 
 
 		 470 aa  70.9  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1175  hypothetical protein  28.38 
 
 		 290 aa  70.9  0.00000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0195  TraG family protein  22.36 
 
 		 457 aa  69.7  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0250  TraG family protein  22.17 
 
 		 457 aa  68.2  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0361  sex pilus assembly and mating pair formation  23.53 
 
 		 589 aa  67  0.0000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.398823  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2122  TraG family protein  22.47 
 
 		 464 aa  65.5  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3686  DotL  22.5 
 
 		 786 aa  48.1  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00900266  normal  0.235831 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1026  hypothetical protein  26.11 
 
 		 657 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.272564 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2966  hypothetical protein  25.7 
 
 		 1187 aa  44.7  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>