59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1454 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4179  putative plasmid transfer protein  60.89 
 
 		 704 aa  839    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2845  hypothetical protein  72.8 
 
 		 721 aa  1100    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3305  hypothetical protein  68.64 
 
 		 707 aa  983    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.705232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3937  hypothetical protein  52.37 
 
 		 664 aa  717    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.280709  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0527  hypothetical protein  73.06 
 
 		 730 aa  1070    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1274  hypothetical protein  73.08 
 
 		 730 aa  1054    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1408  hypothetical protein  72.94 
 
 		 730 aa  1051    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.950579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4169  hypothetical protein  72.09 
 
 		 727 aa  1064    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.48663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2208  hypothetical protein  73.95 
 
 		 718 aa  1111    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.395932  normal  0.45265 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0963  hypothetical protein  73.57 
 
 		 718 aa  1116    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.969966  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2380  hypothetical protein  73.53 
 
 		 718 aa  1102    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.248119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4096  putative plasmid transfer protein  60.23 
 
 		 730 aa  847    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2934  hypothetical protein  68.79 
 
 		 708 aa  981    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4501  TraG/TraD family protein  73.53 
 
 		 743 aa  1131    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0326  putative plasmid transfer protein  61.09 
 
 		 704 aa  844    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0141312 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3718  hypothetical protein  57.76 
 
 		 706 aa  835    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.387295  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3414  hypothetical protein  72.37 
 
 		 733 aa  1065    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41428  normal  0.0672009 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1751  hypothetical protein  55.31 
 
 		 743 aa  800    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59690  hypothetical protein  72.36 
 
 		 744 aa  1120    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000194089  decreased coverage  4.4297400000000005e-19 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2336  hypothetical protein  72.15 
 
 		 729 aa  1063    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000037751  unclonable  0.000000407207 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1454  hypothetical protein  100 
 
 		 719 aa  1486    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.244013 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1195  hypothetical protein  71.15 
 
 		 728 aa  1063    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1638  hypothetical protein  72.89 
 
 		 719 aa  1078    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0645  TraG-family protein  59.58 
 
 		 703 aa  857    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0673  hypothetical protein  73.96 
 
 		 719 aa  1115    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0448  hypothetical protein  71.31 
 
 		 719 aa  1058    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0632  hypothetical protein  54.61 
 
 		 708 aa  756    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3012  hypothetical protein  69.45 
 
 		 701 aa  999    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0881  hypothetical protein  99.65 
 
 		 293 aa  582  1e-164  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2764  hypothetical protein  44.3 
 
 		 752 aa  551  1e-155  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.656214  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2398  hypothetical protein  36.64 
 
 		 668 aa  452  1e-125  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1016  hypothetical protein  37.78 
 
 		 644 aa  449  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1055  hypothetical protein  38.15 
 
 		 659 aa  448  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1175  hypothetical protein  68.37 
 
 		 290 aa  302  2e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4330  hypothetical protein  31.11 
 
 		 637 aa  285  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.930628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0066  type IV conjugative transfer system protein TraD  28.29 
 
 		 621 aa  284  5.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4266  hypothetical protein  30.92 
 
 		 629 aa  266  1e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2815  type IV conjugative transfer system protein TraD  29.7 
 
 		 615 aa  265  2e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5613  hypothetical protein  30.99 
 
 		 622 aa  255  3e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.920464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3750  hypothetical protein  29.2 
 
 		 635 aa  250  5e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.294412 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6502  hypothetical protein  30.58 
 
 		 622 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.571397  normal  0.732963 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1518  hypothetical protein  30.39 
 
 		 618 aa  241  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.328078  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5183  hypothetical protein  30.39 
 
 		 618 aa  241  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6309  hypothetical protein  30.5 
 
 		 622 aa  240  5.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.800389  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4741  hypothetical protein  29.15 
 
 		 629 aa  228  3e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.404612 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5224  hypothetical protein  27.79 
 
 		 650 aa  227  5.0000000000000005e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.571099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2307  hypothetical protein  28.53 
 
 		 635 aa  226  1e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.973941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2598  hypothetical protein  28.01 
 
 		 635 aa  224  6e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.887082  normal  0.897508 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1549  hypothetical protein  26.98 
 
 		 633 aa  222  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.167533  normal  0.131321 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5471  hypothetical protein  26.76 
 
 		 635 aa  191  5e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.170815 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4264  hypothetical protein  24.66 
 
 		 624 aa  164  6e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000613459  normal  0.436086 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2122  TraG family protein  23.65 
 
 		 464 aa  93.6  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3798  TraG family protein  23.32 
 
 		 470 aa  84  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0250  TraG family protein  21.93 
 
 		 457 aa  83.2  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0195  TraG family protein  21.5 
 
 		 457 aa  80.9  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0837  DNA transfer in the process of conjugation and F pilus assembly protein  23.04 
 
 		 455 aa  74.3  0.000000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00362529  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0361  sex pilus assembly and mating pair formation  20.57 
 
 		 589 aa  65.5  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.398823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0738  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  22.71 
 
 		 557 aa  59.7  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1251  lipoprotein, putative  31.45 
 
 		 619 aa  50.1  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.684077  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>