52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0881 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0881  hypothetical protein  100 
 
 		 293 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1454  hypothetical protein  99.65 
 
 		 719 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.244013 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4501  TraG/TraD family protein  76.68 
 
 		 743 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59690  hypothetical protein  75.35 
 
 		 744 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000194089  decreased coverage  4.4297400000000005e-19 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0963  hypothetical protein  72.34 
 
 		 718 aa  427  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.969966  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2845  hypothetical protein  73.21 
 
 		 721 aa  427  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0673  hypothetical protein  72.89 
 
 		 719 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2208  hypothetical protein  72.2 
 
 		 718 aa  420  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.395932  normal  0.45265 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2380  hypothetical protein  72.3 
 
 		 718 aa  417  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.248119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3414  hypothetical protein  73.36 
 
 		 733 aa  417  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41428  normal  0.0672009 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1638  hypothetical protein  72.99 
 
 		 719 aa  416  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4169  hypothetical protein  72.63 
 
 		 727 aa  414  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.48663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1195  hypothetical protein  69.9 
 
 		 728 aa  414  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2336  hypothetical protein  72.79 
 
 		 729 aa  413  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000037751  unclonable  0.000000407207 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0448  hypothetical protein  70.7 
 
 		 719 aa  407  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1274  hypothetical protein  75.79 
 
 		 730 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1408  hypothetical protein  75.4 
 
 		 730 aa  404  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.950579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0527  hypothetical protein  72.59 
 
 		 730 aa  403  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3305  hypothetical protein  70.16 
 
 		 707 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.705232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2934  hypothetical protein  69.77 
 
 		 708 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3012  hypothetical protein  68.08 
 
 		 701 aa  362  4e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0645  TraG-family protein  60.74 
 
 		 703 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3718  hypothetical protein  58.84 
 
 		 706 aa  333  1e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.387295  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4179  putative plasmid transfer protein  64.06 
 
 		 704 aa  330  1e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4096  putative plasmid transfer protein  63.28 
 
 		 730 aa  330  1e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0326  putative plasmid transfer protein  63.28 
 
 		 704 aa  328  6e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0141312 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1751  hypothetical protein  55.4 
 
 		 743 aa  310  2e-83  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1175  hypothetical protein  68.37 
 
 		 290 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3937  hypothetical protein  55.51 
 
 		 664 aa  302  4.0000000000000003e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.280709  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0632  hypothetical protein  53.85 
 
 		 708 aa  293  2e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2764  hypothetical protein  48.05 
 
 		 752 aa  237  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.656214  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1016  hypothetical protein  44.65 
 
 		 644 aa  191  2e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2398  hypothetical protein  41.45 
 
 		 668 aa  189  5e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1055  hypothetical protein  44.29 
 
 		 659 aa  185  6e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2815  type IV conjugative transfer system protein TraD  35.02 
 
 		 615 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5613  hypothetical protein  35.94 
 
 		 622 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.920464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1518  hypothetical protein  34.56 
 
 		 618 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.328078  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5183  hypothetical protein  34.56 
 
 		 618 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0066  type IV conjugative transfer system protein TraD  32.26 
 
 		 621 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6309  hypothetical protein  35.91 
 
 		 622 aa  121  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.800389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4330  hypothetical protein  32.27 
 
 		 637 aa  119  7e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.930628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6502  hypothetical protein  33.64 
 
 		 622 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.571397  normal  0.732963 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3750  hypothetical protein  32.08 
 
 		 635 aa  117  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.294412 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1549  hypothetical protein  31.11 
 
 		 633 aa  107  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.167533  normal  0.131321 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4741  hypothetical protein  31.48 
 
 		 629 aa  106  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.404612 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2307  hypothetical protein  32 
 
 		 635 aa  104  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.973941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4266  hypothetical protein  33.18 
 
 		 629 aa  103  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2598  hypothetical protein  30.57 
 
 		 635 aa  103  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.887082  normal  0.897508 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5224  hypothetical protein  29.22 
 
 		 650 aa  88.2  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.571099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5471  hypothetical protein  28.38 
 
 		 635 aa  79.7  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.170815 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4264  hypothetical protein  25.93 
 
 		 624 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000613459  normal  0.436086 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0738  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  25.36 
 
 		 557 aa  45.4  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>