41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8472 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0140  AAA ATPase  78.56 
 
 		 823 aa  1320    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.272915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0477  ATPase  77.58 
 
 		 827 aa  1301    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3057  AAA ATPase  87.3 
 
 		 816 aa  1459    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8472  hypothetical protein  100 
 
 		 830 aa  1692    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547779  normal  0.957952 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1100  AAA ATPase  82.61 
 
 		 821 aa  1375    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0231  hypothetical protein  27.74 
 
 		 846 aa  280  9e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4735  hypothetical protein  28.84 
 
 		 1114 aa  261  3e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000107106 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4299  hypothetical protein  28.37 
 
 		 1056 aa  248  3e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.511127 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0484  hypothetical protein  28.31 
 
 		 1201 aa  245  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0181373 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1445  hypothetical protein  28.57 
 
 		 819 aa  206  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.218302  normal  0.184359 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07280  hypothetical protein  26.27 
 
 		 980 aa  172  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0886  hypothetical protein  25.55 
 
 		 955 aa  172  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0044  hypothetical protein  25.87 
 
 		 856 aa  162  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3115  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  28.86 
 
 		 802 aa  162  3e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0575  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  28.65 
 
 		 802 aa  158  3e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0794  hypothetical protein  29.44 
 
 		 805 aa  144  7e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1167  hypothetical protein  27.08 
 
 		 826 aa  141  4.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2508  hypothetical protein  25.75 
 
 		 792 aa  140  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0860063 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2001  conjugal transfer protein, interruption-C  22.96 
 
 		 756 aa  128  4.0000000000000003e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.396509  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0308  hypothetical protein  27.18 
 
 		 807 aa  123  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.287416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1037  conjugal transfer protein, ATPase  23.47 
 
 		 832 aa  103  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0639  hypothetical protein  28.11 
 
 		 920 aa  103  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5943  hypothetical protein  22.65 
 
 		 832 aa  69.7  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5541  hypothetical protein  22.65 
 
 		 832 aa  69.7  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.0696223 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5543  hypothetical protein  22.72 
 
 		 818 aa  67.4  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0178014 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0731  AAA ATPase  22.89 
 
 		 569 aa  57.8  0.0000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0912969  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2720  hypothetical protein  23.25 
 
 		 442 aa  55.8  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0146207  hitchhiker  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5371  Type-IV secretion system protein TraC  24.35 
 
 		 864 aa  55.1  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.622531 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4226  hypothetical protein  22.76 
 
 		 827 aa  53.5  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4631  hypothetical protein  22.82 
 
 		 1028 aa  53.1  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4741  hypothetical protein  29.11 
 
 		 629 aa  51.2  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.404612 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6849  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.51 
 
 		 608 aa  48.5  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0610151  normal  0.925039 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8579  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.85 
 
 		 595 aa  48.5  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161073  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0535  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  25.21 
 
 		 501 aa  48.5  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.162196  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1693  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  22.49 
 
 		 629 aa  48.5  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000521447  normal  0.17897 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0714  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  27.17 
 
 		 611 aa  47.4  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2548  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.81 
 
 		 629 aa  46.6  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0379852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  23.91 
 
 		 496 aa  45.4  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5224  hypothetical protein  60.53 
 
 		 650 aa  45.4  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.571099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3439  hypothetical protein  22.15 
 
 		 856 aa  45.1  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5501  hypothetical protein  23.63 
 
 		 862 aa  44.7  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.432777  hitchhiker  0.0032369 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>