45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1100 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0140  AAA ATPase  80.25 
 
 		 823 aa  1327    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.272915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0477  ATPase  78.99 
 
 		 827 aa  1321    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3057  AAA ATPase  82.81 
 
 		 816 aa  1355    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8472  hypothetical protein  82.09 
 
 		 830 aa  1382    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547779  normal  0.957952 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1100  AAA ATPase  100 
 
 		 821 aa  1662    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0231  hypothetical protein  27.83 
 
 		 846 aa  287  4e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0484  hypothetical protein  28.31 
 
 		 1201 aa  255  3e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0181373 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4735  hypothetical protein  28.59 
 
 		 1114 aa  254  4.0000000000000004e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000107106 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4299  hypothetical protein  28.24 
 
 		 1056 aa  253  1e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.511127 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1445  hypothetical protein  27.85 
 
 		 819 aa  194  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.218302  normal  0.184359 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0886  hypothetical protein  25.97 
 
 		 955 aa  192  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07280  hypothetical protein  26.35 
 
 		 980 aa  190  1e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0044  hypothetical protein  25.95 
 
 		 856 aa  164  6e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2508  hypothetical protein  26.22 
 
 		 792 aa  157  7e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0860063 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0794  hypothetical protein  26.08 
 
 		 805 aa  150  7e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0575  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  27.31 
 
 		 802 aa  148  5e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3115  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  27.49 
 
 		 802 aa  147  6e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1167  hypothetical protein  24.41 
 
 		 826 aa  129  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0308  hypothetical protein  27.86 
 
 		 807 aa  125  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.287416  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2001  conjugal transfer protein, interruption-C  24.17 
 
 		 756 aa  124  7e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.396509  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0639  hypothetical protein  26.45 
 
 		 920 aa  102  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1037  conjugal transfer protein, ATPase  23.04 
 
 		 832 aa  102  3e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5541  hypothetical protein  24.21 
 
 		 832 aa  82.4  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.0696223 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5943  hypothetical protein  24.21 
 
 		 832 aa  82.4  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5543  hypothetical protein  22.57 
 
 		 818 aa  68.2  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0178014 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5371  Type-IV secretion system protein TraC  24.03 
 
 		 864 aa  59.7  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.622531 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4631  hypothetical protein  23.46 
 
 		 1028 aa  56.2  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4226  hypothetical protein  23.02 
 
 		 827 aa  55.8  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2720  hypothetical protein  24.84 
 
 		 442 aa  55.1  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0146207  hitchhiker  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8579  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.79 
 
 		 595 aa  53.5  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161073  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0731  AAA ATPase  22.12 
 
 		 569 aa  53.1  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0912969  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5501  hypothetical protein  24.67 
 
 		 862 aa  52.4  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.432777  hitchhiker  0.0032369 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4741  hypothetical protein  30.82 
 
 		 629 aa  52  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.404612 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4006  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  22.55 
 
 		 868 aa  51.6  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.840318  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4376  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  21.97 
 
 		 785 aa  51.2  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.851787 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2548  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  22.22 
 
 		 629 aa  49.7  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0379852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1693  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  21.19 
 
 		 629 aa  50.1  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000521447  normal  0.17897 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3439  hypothetical protein  22.76 
 
 		 856 aa  48.9  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0371  F-pilin subunit assembly into extended F pili  23.4 
 
 		 809 aa  46.2  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.221651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  24.53 
 
 		 496 aa  46.2  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0028  hypothetical protein  23.83 
 
 		 858 aa  45.4  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0798103  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0805  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  25.96 
 
 		 495 aa  45.8  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0936  protein of unknown function DUF853 NPT hydrolase putative  23.58 
 
 		 521 aa  45.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1617  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system, conserved region  32.93 
 
 		 819 aa  44.7  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5224  hypothetical protein  47.27 
 
 		 650 aa  44.3  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.571099  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>