18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5541 on replicon NC_008147
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008147  Mmcs_5541  hypothetical protein  100 
 
 
832 aa  1699    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.0696223 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5943  hypothetical protein  100 
 
 
832 aa  1699    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3439  hypothetical protein  34.7 
 
 
856 aa  412  1e-113  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5543  hypothetical protein  30.16 
 
 
818 aa  358  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0178014 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4631  hypothetical protein  30.96 
 
 
1028 aa  349  1e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5501  hypothetical protein  26.45 
 
 
862 aa  233  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.432777  hitchhiker  0.0032369 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1100  AAA ATPase  24.21 
 
 
821 aa  82.8  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3057  AAA ATPase  23.26 
 
 
816 aa  77.8  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1445  hypothetical protein  25.34 
 
 
819 aa  73.2  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.218302  normal  0.184359 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0231  hypothetical protein  20.6 
 
 
846 aa  70.9  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8472  hypothetical protein  22.65 
 
 
830 aa  69.7  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547779  normal  0.957952 
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0044  hypothetical protein  21.71 
 
 
856 aa  66.2  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0477  ATPase  27.01 
 
 
827 aa  61.2  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0140  AAA ATPase  22.78 
 
 
823 aa  60.5  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.272915  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0886  hypothetical protein  25.22 
 
 
955 aa  59.3  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0575  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.58 
 
 
802 aa  48.1  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07280  hypothetical protein  23.68 
 
 
980 aa  47  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3115  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.79 
 
 
802 aa  45.8  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>