30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0057 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0057  hypothetical protein  100 
 
 		 952 aa  1956    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.889998  hitchhiker  0.00629192 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0488  hypothetical protein  46.86 
 
 		 783 aa  590  1e-167  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0512  hypothetical protein  46.86 
 
 		 783 aa  589  1e-166  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0366  IcmO  49.67 
 
 		 792 aa  561  1e-158  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1816  IcmO protein  49.5 
 
 		 792 aa  560  1e-158  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0122  putative type IV secretion system protein IcmO/DotL  37.4 
 
 		 934 aa  399  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3686  DotL  32.72 
 
 		 786 aa  290  1e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00900266  normal  0.235831 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4265  hypothetical protein  30.4 
 
 		 950 aa  259  1e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0068  TraG/TraD family conjugal transfer protein  29.34 
 
 		 762 aa  231  5e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0076  trbC protein  29.34 
 
 		 762 aa  231  5e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0075  TrbC  27.72 
 
 		 763 aa  195  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0356259 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0057  hypothetical protein  26.43 
 
 		 590 aa  136  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0209487  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03523  TrbC-like protein  29.5 
 
 		 387 aa  115  5e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.236251  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0361  sex pilus assembly and mating pair formation  23.95 
 
 		 589 aa  92.4  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.398823  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03474  hypothetical protein  35.29 
 
 		 171 aa  65.5  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.481674  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3242  hypothetical protein  25.59 
 
 		 612 aa  62  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3798  TraG family protein  21.72 
 
 		 470 aa  54.3  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0195  TraG family protein  29.17 
 
 		 457 aa  52  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0250  TraG family protein  29.17 
 
 		 457 aa  51.6  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2122  TraG family protein  22.81 
 
 		 464 aa  50.8  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1251  lipoprotein, putative  35.48 
 
 		 619 aa  49.3  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.684077  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0632  hypothetical protein  26.22 
 
 		 708 aa  48.5  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0738  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  22.25 
 
 		 557 aa  48.1  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3718  hypothetical protein  28.7 
 
 		 706 aa  47.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.387295  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0645  TraG-family protein  27.44 
 
 		 703 aa  46.2  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4169  hypothetical protein  29.71 
 
 		 727 aa  45.8  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.48663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0837  DNA transfer in the process of conjugation and F pilus assembly protein  26.03 
 
 		 455 aa  45.8  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00362529  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1408  hypothetical protein  29.03 
 
 		 730 aa  45.1  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.950579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1274  hypothetical protein  29.03 
 
 		 730 aa  45.1  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2764  hypothetical protein  37.5 
 
 		 752 aa  44.7  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.656214  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>