24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl0488 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010117  COXBURSA331_A1816  IcmO protein  60.46 
 
 		 792 aa  969    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0366  IcmO  60.59 
 
 		 792 aa  971    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0512  hypothetical protein  99.74 
 
 		 783 aa  1600    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0488  hypothetical protein  100 
 
 		 783 aa  1605    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0057  hypothetical protein  48.39 
 
 		 952 aa  590  1e-167  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.889998  hitchhiker  0.00629192 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0122  putative type IV secretion system protein IcmO/DotL  40.31 
 
 		 934 aa  454  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3686  DotL  35.89 
 
 		 786 aa  395  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00900266  normal  0.235831 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4265  hypothetical protein  34.49 
 
 		 950 aa  358  1.9999999999999998e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0068  TraG/TraD family conjugal transfer protein  28.92 
 
 		 762 aa  273  1e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0076  trbC protein  28.92 
 
 		 762 aa  273  1e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0075  TrbC  25.96 
 
 		 763 aa  231  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0356259 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0057  hypothetical protein  26.08 
 
 		 590 aa  165  3e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0209487  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03523  TrbC-like protein  30.8 
 
 		 387 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.236251  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0361  sex pilus assembly and mating pair formation  25.06 
 
 		 589 aa  92.4  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.398823  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03474  hypothetical protein  45.07 
 
 		 171 aa  67.8  0.0000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.481674  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1251  lipoprotein, putative  21.53 
 
 		 619 aa  61.6  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.684077  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2122  TraG family protein  31.91 
 
 		 464 aa  54.7  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0195  TraG family protein  34.38 
 
 		 457 aa  52.8  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0837  DNA transfer in the process of conjugation and F pilus assembly protein  30.68 
 
 		 455 aa  52.8  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00362529  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0250  TraG family protein  34.38 
 
 		 457 aa  52.4  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1505  hypothetical protein  39.39 
 
 		 753 aa  47  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1405  TRAG family protein  29.01 
 
 		 827 aa  45.8  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3798  TraG family protein  26.32 
 
 		 470 aa  45.4  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0738  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  33.77 
 
 		 557 aa  45.1  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>