16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_03523 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03523  TrbC-like protein  100 
 
 		 387 aa  809    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.236251  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0075  TrbC  56.94 
 
 		 763 aa  433  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0356259 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03474  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  360  3e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.481674  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0068  TraG/TraD family conjugal transfer protein  39.64 
 
 		 762 aa  252  7e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0076  trbC protein  39.64 
 
 		 762 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0057  hypothetical protein  60.11 
 
 		 590 aa  227  3e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0209487  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0512  hypothetical protein  28.19 
 
 		 783 aa  135  9e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0488  hypothetical protein  28.24 
 
 		 783 aa  134  3e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0366  IcmO  25.53 
 
 		 792 aa  133  5e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1816  IcmO protein  25.53 
 
 		 792 aa  133  5e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3686  DotL  30 
 
 		 786 aa  132  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00900266  normal  0.235831 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0057  hypothetical protein  28.4 
 
 		 952 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.889998  hitchhiker  0.00629192 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4265  hypothetical protein  27.53 
 
 		 950 aa  96.7  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0122  putative type IV secretion system protein IcmO/DotL  28.06 
 
 		 934 aa  89  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0361  sex pilus assembly and mating pair formation  24.68 
 
 		 589 aa  45.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.398823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1251  lipoprotein, putative  24.84 
 
 		 619 aa  45.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.684077  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>