29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_B0122 on replicon NC_009705
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009705  YpsIP31758_B0122  putative type IV secretion system protein IcmO/DotL  100 
 
 		 934 aa  1914    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0512  hypothetical protein  40 
 
 		 783 aa  454  1.0000000000000001e-126  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0488  hypothetical protein  40.47 
 
 		 783 aa  454  1.0000000000000001e-126  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0366  IcmO  39.25 
 
 		 792 aa  445  1e-123  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1816  IcmO protein  39.25 
 
 		 792 aa  444  1e-123  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0057  hypothetical protein  37.4 
 
 		 952 aa  399  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.889998  hitchhiker  0.00629192 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3686  DotL  28.7 
 
 		 786 aa  250  9e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00900266  normal  0.235831 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4265  hypothetical protein  28.15 
 
 		 950 aa  218  2.9999999999999998e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0076  trbC protein  30.22 
 
 		 762 aa  218  4e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0068  TraG/TraD family conjugal transfer protein  30.22 
 
 		 762 aa  218  4e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0075  TrbC  26.29 
 
 		 763 aa  167  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0356259 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0057  hypothetical protein  24.61 
 
 		 590 aa  124  9e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0209487  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03523  TrbC-like protein  28.06 
 
 		 387 aa  89.4  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.236251  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0361  sex pilus assembly and mating pair formation  23.27 
 
 		 589 aa  77  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.398823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0837  DNA transfer in the process of conjugation and F pilus assembly protein  31.46 
 
 		 455 aa  48.5  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00362529  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1696  hypothetical protein  34.52 
 
 		 764 aa  48.5  0.0006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000294033  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0195  TraG family protein  30.43 
 
 		 457 aa  48.1  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0250  TraG family protein  34.85 
 
 		 457 aa  47.8  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2122  TraG family protein  34.29 
 
 		 464 aa  47.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1016  hypothetical protein  22.04 
 
 		 644 aa  47.4  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1505  hypothetical protein  38.81 
 
 		 753 aa  46.6  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1346  hypothetical protein  42.37 
 
 		 859 aa  45.8  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1251  lipoprotein, putative  21.32 
 
 		 619 aa  45.8  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.684077  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1055  hypothetical protein  20.75 
 
 		 659 aa  45.4  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03474  hypothetical protein  34.21 
 
 		 171 aa  45.1  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.481674  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0738  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  38.03 
 
 		 557 aa  45.1  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1085  hypothetical protein  41.18 
 
 		 847 aa  44.7  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0066  type IV conjugative transfer system protein TraD  35.71 
 
 		 621 aa  44.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0983  hypothetical protein  34.33 
 
 		 762 aa  44.7  0.009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.137038  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>