31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2549 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2549  hypothetical protein  100 
 
 		 832 aa  1630    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2745  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  84.48 
 
 		 841 aa  1237    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1694  Type IV secretory pathway VirD4 components-like  93.63 
 
 		 832 aa  1349    Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000925009  normal  0.0597569 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4079  hypothetical protein  51.37 
 
 		 876 aa  672    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00459285  normal  0.104503 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6729  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  52.73 
 
 		 830 aa  626  1e-178  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.577691  normal  0.546954 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6850  type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  47.53 
 
 		 833 aa  605  9.999999999999999e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0108098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8580  type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  43.76 
 
 		 792 aa  588  1e-166  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.384634  normal  0.281416 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2068  hypothetical protein  37.3 
 
 		 728 aa  224  4.9999999999999996e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000291289  normal  0.0152831 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0906  Type IV secretory pathway VirD4 components-like  33.87 
 
 		 765 aa  224  6e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7330  type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  31.78 
 
 		 719 aa  192  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000633696  decreased coverage  0.00000000626768 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1436  hypothetical protein  33.82 
 
 		 737 aa  170  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0188035  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0314  hypothetical protein  29.37 
 
 		 425 aa  169  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0295  hypothetical protein  28.85 
 
 		 400 aa  139  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.690441  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5953  hypothetical protein  29.43 
 
 		 751 aa  138  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5981  hypothetical protein  27.79 
 
 		 747 aa  123  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5107  hypothetical protein  26.14 
 
 		 991 aa  112  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.286492  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4007  hypothetical protein  25.56 
 
 		 976 aa  96.3  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.109226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0069  hypothetical protein  28.84 
 
 		 969 aa  96.3  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0314244  hitchhiker  0.0000262699 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2031  hypothetical protein  34.42 
 
 		 205 aa  94.4  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3629  hypothetical protein  22.51 
 
 		 1276 aa  87  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0342  hypothetical protein  26.63 
 
 		 742 aa  81.6  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460096 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3174  hypothetical protein  24.57 
 
 		 1009 aa  70.9  0.00000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0297  hypothetical protein  24.73 
 
 		 1123 aa  70.9  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1449  hypothetical protein  24.44 
 
 		 1319 aa  58.2  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.331748  normal  0.0633529 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2122  TraG family protein  23.72 
 
 		 464 aa  55.8  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1027  hypothetical protein  22.66 
 
 		 791 aa  52.4  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2966  hypothetical protein  25.09 
 
 		 1187 aa  48.9  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0250  TraG family protein  39.29 
 
 		 457 aa  45.8  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0195  TraG family protein  39.29 
 
 		 457 aa  45.8  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0064  TraG/TraD family conjugal transfer protein  26.76 
 
 		 1109 aa  44.3  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0221  TraG/TraD family conjugal transfer protein  25.62 
 
 		 1025 aa  44.3  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>