30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2031 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2031  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  421  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0314  hypothetical protein  47.1 
 
 		 425 aa  152  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4079  hypothetical protein  34.39 
 
 		 876 aa  109  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00459285  normal  0.104503 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0295  hypothetical protein  43.31 
 
 		 400 aa  103  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.690441  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6729  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  36.43 
 
 		 830 aa  101  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.577691  normal  0.546954 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0906  Type IV secretory pathway VirD4 components-like  35.25 
 
 		 765 aa  94.7  9e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1694  Type IV secretory pathway VirD4 components-like  34.42 
 
 		 832 aa  94.4  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000925009  normal  0.0597569 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2549  hypothetical protein  34.42 
 
 		 832 aa  94  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2745  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  33.54 
 
 		 841 aa  90.1  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7330  type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  35.94 
 
 		 719 aa  82  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000633696  decreased coverage  0.00000000626768 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6850  type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  30.22 
 
 		 833 aa  79.3  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0108098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8580  type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  30.23 
 
 		 792 aa  77  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.384634  normal  0.281416 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2068  hypothetical protein  30.83 
 
 		 728 aa  69.3  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000291289  normal  0.0152831 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3629  hypothetical protein  31.62 
 
 		 1276 aa  66.2  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5981  hypothetical protein  29.14 
 
 		 747 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5953  hypothetical protein  31.61 
 
 		 751 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1436  hypothetical protein  29.88 
 
 		 737 aa  58.2  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0188035  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5107  hypothetical protein  27.27 
 
 		 991 aa  52.4  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.286492  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0837  DNA transfer in the process of conjugation and F pilus assembly protein  33.33 
 
 		 455 aa  51.2  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00362529  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2294  hypothetical protein  32.89 
 
 		 411 aa  48.5  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.147546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0195  TraG family protein  32.53 
 
 		 457 aa  46.6  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0342  hypothetical protein  25.26 
 
 		 742 aa  45.8  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460096 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0250  TraG family protein  31.33 
 
 		 457 aa  45.4  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2398  hypothetical protein  34.52 
 
 		 668 aa  45.4  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2764  hypothetical protein  37.29 
 
 		 752 aa  42.4  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.656214  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1016  hypothetical protein  43.48 
 
 		 644 aa  42  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1055  hypothetical protein  43.48 
 
 		 659 aa  42  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0069  hypothetical protein  24.46 
 
 		 969 aa  41.6  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0314244  hitchhiker  0.0000262699 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2122  TraG family protein  27.59 
 
 		 464 aa  41.2  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3798  TraG family protein  43.48 
 
 		 470 aa  41.2  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>